Protein–RNA interactions for Protein: Q9D132

Upk1a, Uroplakin-1a, mousemouse

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk1aQ9D132 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upk1aQ9D132 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upk1aQ9D132 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upk1aQ9D132 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upk1aQ9D132 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upk1aQ9D132 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upk1aQ9D132 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upk1aQ9D132 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upk1aQ9D132 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upk1aQ9D132 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upk1aQ9D132 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upk1aQ9D132 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upk1aQ9D132 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upk1aQ9D132 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upk1aQ9D132 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upk1aQ9D132 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upk1aQ9D132 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upk1aQ9D132 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upk1aQ9D132 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upk1aQ9D132 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upk1aQ9D132 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Upk1aQ9D132 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Upk1aQ9D132 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upk1aQ9D132 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upk1aQ9D132 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upk1aQ9D132 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upk1aQ9D132 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upk1aQ9D132 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upk1aQ9D132 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upk1aQ9D132 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upk1aQ9D132 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upk1aQ9D132 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upk1aQ9D132 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upk1aQ9D132 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upk1aQ9D132 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upk1aQ9D132 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upk1aQ9D132 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upk1aQ9D132 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upk1aQ9D132 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upk1aQ9D132 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upk1aQ9D132 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upk1aQ9D132 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upk1aQ9D132 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upk1aQ9D132 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Upk1aQ9D132 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Upk1aQ9D132 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Upk1aQ9D132 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Upk1aQ9D132 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upk1aQ9D132 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Upk1aQ9D132 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upk1aQ9D132 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upk1aQ9D132 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upk1aQ9D132 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Upk1aQ9D132 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Upk1aQ9D132 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Upk1aQ9D132 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Upk1aQ9D132 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Upk1aQ9D132 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Upk1aQ9D132 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Upk1aQ9D132 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Upk1aQ9D132 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Upk1aQ9D132 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Upk1aQ9D132 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Upk1aQ9D132 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Upk1aQ9D132 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Upk1aQ9D132 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Upk1aQ9D132 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Upk1aQ9D132 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Upk1aQ9D132 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Upk1aQ9D132 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Upk1aQ9D132 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Upk1aQ9D132 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Upk1aQ9D132 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upk1aQ9D132 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upk1aQ9D132 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upk1aQ9D132 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upk1aQ9D132 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upk1aQ9D132 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upk1aQ9D132 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upk1aQ9D132 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upk1aQ9D132 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Upk1aQ9D132 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upk1aQ9D132 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upk1aQ9D132 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upk1aQ9D132 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upk1aQ9D132 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Upk1aQ9D132 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upk1aQ9D132 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upk1aQ9D132 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upk1aQ9D132 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upk1aQ9D132 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upk1aQ9D132 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upk1aQ9D132 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upk1aQ9D132 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upk1aQ9D132 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upk1aQ9D132 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upk1aQ9D132 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upk1aQ9D132 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upk1aQ9D132 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upk1aQ9D132 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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