Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gtf2e1Q9D0D5 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gtf2e1Q9D0D5 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gtf2e1Q9D0D5 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gtf2e1Q9D0D5 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gtf2e1Q9D0D5 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gtf2e1Q9D0D5 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Gtf2e1Q9D0D5 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gtf2e1Q9D0D5 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gtf2e1Q9D0D5 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gtf2e1Q9D0D5 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gtf2e1Q9D0D5 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gtf2e1Q9D0D5 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtf2e1Q9D0D5 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtf2e1Q9D0D5 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtf2e1Q9D0D5 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtf2e1Q9D0D5 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtf2e1Q9D0D5 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtf2e1Q9D0D5 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtf2e1Q9D0D5 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtf2e1Q9D0D5 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtf2e1Q9D0D5 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtf2e1Q9D0D5 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtf2e1Q9D0D5 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtf2e1Q9D0D5 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtf2e1Q9D0D5 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtf2e1Q9D0D5 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtf2e1Q9D0D5 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtf2e1Q9D0D5 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtf2e1Q9D0D5 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtf2e1Q9D0D5 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtf2e1Q9D0D5 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtf2e1Q9D0D5 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtf2e1Q9D0D5 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtf2e1Q9D0D5 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtf2e1Q9D0D5 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtf2e1Q9D0D5 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gtf2e1Q9D0D5 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gtf2e1Q9D0D5 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gtf2e1Q9D0D5 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gtf2e1Q9D0D5 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gtf2e1Q9D0D5 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gtf2e1Q9D0D5 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Gtf2e1Q9D0D5 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gtf2e1Q9D0D5 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gtf2e1Q9D0D5 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gtf2e1Q9D0D5 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtf2e1Q9D0D5 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtf2e1Q9D0D5 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtf2e1Q9D0D5 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtf2e1Q9D0D5 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtf2e1Q9D0D5 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtf2e1Q9D0D5 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtf2e1Q9D0D5 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtf2e1Q9D0D5 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtf2e1Q9D0D5 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtf2e1Q9D0D5 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtf2e1Q9D0D5 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtf2e1Q9D0D5 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtf2e1Q9D0D5 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtf2e1Q9D0D5 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtf2e1Q9D0D5 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtf2e1Q9D0D5 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtf2e1Q9D0D5 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtf2e1Q9D0D5 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Gtf2e1Q9D0D5 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gtf2e1Q9D0D5 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Gtf2e1Q9D0D5 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gtf2e1Q9D0D5 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gtf2e1Q9D0D5 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gtf2e1Q9D0D5 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gtf2e1Q9D0D5 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gtf2e1Q9D0D5 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gtf2e1Q9D0D5 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gtf2e1Q9D0D5 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gtf2e1Q9D0D5 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gtf2e1Q9D0D5 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gtf2e1Q9D0D5 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gtf2e1Q9D0D5 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gtf2e1Q9D0D5 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gtf2e1Q9D0D5 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gtf2e1Q9D0D5 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gtf2e1Q9D0D5 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gtf2e1Q9D0D5 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gtf2e1Q9D0D5 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gtf2e1Q9D0D5 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Gtf2e1Q9D0D5 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gtf2e1Q9D0D5 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Gtf2e1Q9D0D5 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gtf2e1Q9D0D5 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gtf2e1Q9D0D5 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gtf2e1Q9D0D5 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms