Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc47Q9D024 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc47Q9D024 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc47Q9D024 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc47Q9D024 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc47Q9D024 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc47Q9D024 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc47Q9D024 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc47Q9D024 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc47Q9D024 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc47Q9D024 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc47Q9D024 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc47Q9D024 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc47Q9D024 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc47Q9D024 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc47Q9D024 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc47Q9D024 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc47Q9D024 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc47Q9D024 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc47Q9D024 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc47Q9D024 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc47Q9D024 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc47Q9D024 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc47Q9D024 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc47Q9D024 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc47Q9D024 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc47Q9D024 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc47Q9D024 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc47Q9D024 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc47Q9D024 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc47Q9D024 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc47Q9D024 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc47Q9D024 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc47Q9D024 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc47Q9D024 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc47Q9D024 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc47Q9D024 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc47Q9D024 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc47Q9D024 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc47Q9D024 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc47Q9D024 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc47Q9D024 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc47Q9D024 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc47Q9D024 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc47Q9D024 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc47Q9D024 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc47Q9D024 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc47Q9D024 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc47Q9D024 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc47Q9D024 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc47Q9D024 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc47Q9D024 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc47Q9D024 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc47Q9D024 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc47Q9D024 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc47Q9D024 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc47Q9D024 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc47Q9D024 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc47Q9D024 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc47Q9D024 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc47Q9D024 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc47Q9D024 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc47Q9D024 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc47Q9D024 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc47Q9D024 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc47Q9D024 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc47Q9D024 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc47Q9D024 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc47Q9D024 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc47Q9D024 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc47Q9D024 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc47Q9D024 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc47Q9D024 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc47Q9D024 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc47Q9D024 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc47Q9D024 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc47Q9D024 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc47Q9D024 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc47Q9D024 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc47Q9D024 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc47Q9D024 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc47Q9D024 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc47Q9D024 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc47Q9D024 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc47Q9D024 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc47Q9D024 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc47Q9D024 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc47Q9D024 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc47Q9D024 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc47Q9D024 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc47Q9D024 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc47Q9D024 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc47Q9D024 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc47Q9D024 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc47Q9D024 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc47Q9D024 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc47Q9D024 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc47Q9D024 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc47Q9D024 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc47Q9D024 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
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