Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY97

Ssu72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssu72Q9CY97 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ssu72Q9CY97 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ssu72Q9CY97 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ssu72Q9CY97 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ssu72Q9CY97 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ssu72Q9CY97 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ssu72Q9CY97 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ssu72Q9CY97 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ssu72Q9CY97 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ssu72Q9CY97 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ssu72Q9CY97 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ssu72Q9CY97 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ssu72Q9CY97 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssu72Q9CY97 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssu72Q9CY97 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssu72Q9CY97 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssu72Q9CY97 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssu72Q9CY97 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssu72Q9CY97 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssu72Q9CY97 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssu72Q9CY97 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssu72Q9CY97 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssu72Q9CY97 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssu72Q9CY97 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssu72Q9CY97 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssu72Q9CY97 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssu72Q9CY97 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssu72Q9CY97 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssu72Q9CY97 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssu72Q9CY97 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssu72Q9CY97 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssu72Q9CY97 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssu72Q9CY97 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssu72Q9CY97 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssu72Q9CY97 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssu72Q9CY97 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssu72Q9CY97 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssu72Q9CY97 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssu72Q9CY97 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssu72Q9CY97 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssu72Q9CY97 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ssu72Q9CY97 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ssu72Q9CY97 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ssu72Q9CY97 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssu72Q9CY97 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssu72Q9CY97 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssu72Q9CY97 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssu72Q9CY97 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssu72Q9CY97 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssu72Q9CY97 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssu72Q9CY97 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssu72Q9CY97 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssu72Q9CY97 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssu72Q9CY97 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssu72Q9CY97 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssu72Q9CY97 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssu72Q9CY97 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssu72Q9CY97 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssu72Q9CY97 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssu72Q9CY97 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssu72Q9CY97 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssu72Q9CY97 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssu72Q9CY97 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssu72Q9CY97 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssu72Q9CY97 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssu72Q9CY97 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssu72Q9CY97 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssu72Q9CY97 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssu72Q9CY97 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssu72Q9CY97 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssu72Q9CY97 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssu72Q9CY97 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssu72Q9CY97 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssu72Q9CY97 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssu72Q9CY97 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssu72Q9CY97 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssu72Q9CY97 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssu72Q9CY97 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssu72Q9CY97 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssu72Q9CY97 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssu72Q9CY97 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssu72Q9CY97 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssu72Q9CY97 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssu72Q9CY97 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssu72Q9CY97 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssu72Q9CY97 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssu72Q9CY97 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssu72Q9CY97 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssu72Q9CY97 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssu72Q9CY97 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssu72Q9CY97 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssu72Q9CY97 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssu72Q9CY97 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssu72Q9CY97 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssu72Q9CY97 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssu72Q9CY97 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssu72Q9CY97 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssu72Q9CY97 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ssu72Q9CY97 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ssu72Q9CY97 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms