Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

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Length 349 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Xrcc3Q9CXE6 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Xrcc3Q9CXE6 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Xrcc3Q9CXE6 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Xrcc3Q9CXE6 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Xrcc3Q9CXE6 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Xrcc3Q9CXE6 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Xrcc3Q9CXE6 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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