Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX30

Yif1b, Protein YIF1B, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yif1bQ9CX30 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Yif1bQ9CX30 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Yif1bQ9CX30 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Yif1bQ9CX30 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Yif1bQ9CX30 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Yif1bQ9CX30 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Yif1bQ9CX30 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Yif1bQ9CX30 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Yif1bQ9CX30 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Yif1bQ9CX30 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Yif1bQ9CX30 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Yif1bQ9CX30 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Yif1bQ9CX30 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Yif1bQ9CX30 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Yif1bQ9CX30 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Yif1bQ9CX30 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Yif1bQ9CX30 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Yif1bQ9CX30 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Yif1bQ9CX30 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Yif1bQ9CX30 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Yif1bQ9CX30 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Yif1bQ9CX30 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Yif1bQ9CX30 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Yif1bQ9CX30 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Yif1bQ9CX30 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Yif1bQ9CX30 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Yif1bQ9CX30 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Yif1bQ9CX30 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Yif1bQ9CX30 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Yif1bQ9CX30 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Yif1bQ9CX30 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Yif1bQ9CX30 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Yif1bQ9CX30 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Yif1bQ9CX30 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Yif1bQ9CX30 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Yif1bQ9CX30 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Yif1bQ9CX30 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Yif1bQ9CX30 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Yif1bQ9CX30 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Yif1bQ9CX30 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Yif1bQ9CX30 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Yif1bQ9CX30 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Yif1bQ9CX30 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Yif1bQ9CX30 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Yif1bQ9CX30 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Yif1bQ9CX30 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Yif1bQ9CX30 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Yif1bQ9CX30 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Yif1bQ9CX30 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Yif1bQ9CX30 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Yif1bQ9CX30 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Yif1bQ9CX30 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Yif1bQ9CX30 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Yif1bQ9CX30 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Yif1bQ9CX30 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Yif1bQ9CX30 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Yif1bQ9CX30 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Yif1bQ9CX30 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Yif1bQ9CX30 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Yif1bQ9CX30 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Yif1bQ9CX30 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Yif1bQ9CX30 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Yif1bQ9CX30 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Yif1bQ9CX30 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Yif1bQ9CX30 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Yif1bQ9CX30 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Yif1bQ9CX30 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Yif1bQ9CX30 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Yif1bQ9CX30 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Yif1bQ9CX30 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Yif1bQ9CX30 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Yif1bQ9CX30 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Yif1bQ9CX30 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Yif1bQ9CX30 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Yif1bQ9CX30 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Yif1bQ9CX30 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Yif1bQ9CX30 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Yif1bQ9CX30 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Yif1bQ9CX30 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Yif1bQ9CX30 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Yif1bQ9CX30 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Yif1bQ9CX30 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Yif1bQ9CX30 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Yif1bQ9CX30 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Yif1bQ9CX30 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Yif1bQ9CX30 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Yif1bQ9CX30 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Yif1bQ9CX30 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Yif1bQ9CX30 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Yif1bQ9CX30 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Yif1bQ9CX30 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Yif1bQ9CX30 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Yif1bQ9CX30 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Yif1bQ9CX30 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Yif1bQ9CX30 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Yif1bQ9CX30 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Yif1bQ9CX30 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Yif1bQ9CX30 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Yif1bQ9CX30 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Yif1bQ9CX30 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms