Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tdrd12Q9CWU0 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms