Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUU3

Sycp2, Synaptonemal complex protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2Q9CUU3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Sycp2Q9CUU3 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Sycp2Q9CUU3 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Sycp2Q9CUU3 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Sycp2Q9CUU3 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Sycp2Q9CUU3 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
Sycp2Q9CUU3 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Sycp2Q9CUU3 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Sycp2Q9CUU3 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Sycp2Q9CUU3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Sycp2Q9CUU3 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Sycp2Q9CUU3 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
Sycp2Q9CUU3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
Sycp2Q9CUU3 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
Sycp2Q9CUU3 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
Sycp2Q9CUU3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
Sycp2Q9CUU3 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
Sycp2Q9CUU3 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Sycp2Q9CUU3 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Sycp2Q9CUU3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Sycp2Q9CUU3 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Sycp2Q9CUU3 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Sycp2Q9CUU3 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Sycp2Q9CUU3 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Sycp2Q9CUU3 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Sycp2Q9CUU3 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Sycp2Q9CUU3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Sycp2Q9CUU3 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Sycp2Q9CUU3 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
Sycp2Q9CUU3 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Sycp2Q9CUU3 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Sycp2Q9CUU3 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Sycp2Q9CUU3 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Sycp2Q9CUU3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Sycp2Q9CUU3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Sycp2Q9CUU3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Sycp2Q9CUU3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Sycp2Q9CUU3 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Sycp2Q9CUU3 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Sycp2Q9CUU3 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
Sycp2Q9CUU3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Sycp2Q9CUU3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
Sycp2Q9CUU3 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Sycp2Q9CUU3 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Sycp2Q9CUU3 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Sycp2Q9CUU3 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Sycp2Q9CUU3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Sycp2Q9CUU3 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Sycp2Q9CUU3 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Sycp2Q9CUU3 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
Sycp2Q9CUU3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Sycp2Q9CUU3 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Sycp2Q9CUU3 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Sycp2Q9CUU3 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Sycp2Q9CUU3 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Sycp2Q9CUU3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Sycp2Q9CUU3 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Sycp2Q9CUU3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Sycp2Q9CUU3 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Sycp2Q9CUU3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Sycp2Q9CUU3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Sycp2Q9CUU3 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Sycp2Q9CUU3 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Sycp2Q9CUU3 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Sycp2Q9CUU3 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Sycp2Q9CUU3 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Sycp2Q9CUU3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Sycp2Q9CUU3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Sycp2Q9CUU3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Sycp2Q9CUU3 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Sycp2Q9CUU3 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.49
Sycp2Q9CUU3 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
Sycp2Q9CUU3 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC30.57■■■□□ 2.49
Sycp2Q9CUU3 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.49
Sycp2Q9CUU3 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.49
Sycp2Q9CUU3 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
Sycp2Q9CUU3 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.49
Sycp2Q9CUU3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Sycp2Q9CUU3 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Sycp2Q9CUU3 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Sycp2Q9CUU3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Sycp2Q9CUU3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Sycp2Q9CUU3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Sycp2Q9CUU3 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Sycp2Q9CUU3 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Sycp2Q9CUU3 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Sycp2Q9CUU3 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Sycp2Q9CUU3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Sycp2Q9CUU3 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Sycp2Q9CUU3 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Sycp2Q9CUU3 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Sycp2Q9CUU3 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Sycp2Q9CUU3 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Sycp2Q9CUU3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Sycp2Q9CUU3 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Sycp2Q9CUU3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Sycp2Q9CUU3 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Sycp2Q9CUU3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Sycp2Q9CUU3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Sycp2Q9CUU3 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms