Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUN6

Smurf1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf1Q9CUN6 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smurf1Q9CUN6 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms