Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rhobtb3Q9CTN4 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rhobtb3Q9CTN4 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rhobtb3Q9CTN4 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rhobtb3Q9CTN4 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rhobtb3Q9CTN4 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rhobtb3Q9CTN4 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rhobtb3Q9CTN4 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rhobtb3Q9CTN4 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rhobtb3Q9CTN4 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rhobtb3Q9CTN4 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rhobtb3Q9CTN4 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rhobtb3Q9CTN4 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rhobtb3Q9CTN4 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rhobtb3Q9CTN4 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rhobtb3Q9CTN4 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rhobtb3Q9CTN4 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rhobtb3Q9CTN4 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rhobtb3Q9CTN4 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rhobtb3Q9CTN4 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rhobtb3Q9CTN4 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rhobtb3Q9CTN4 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rhobtb3Q9CTN4 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rhobtb3Q9CTN4 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rhobtb3Q9CTN4 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rhobtb3Q9CTN4 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rhobtb3Q9CTN4 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rhobtb3Q9CTN4 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rhobtb3Q9CTN4 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rhobtb3Q9CTN4 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rhobtb3Q9CTN4 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rhobtb3Q9CTN4 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rhobtb3Q9CTN4 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rhobtb3Q9CTN4 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rhobtb3Q9CTN4 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rhobtb3Q9CTN4 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rhobtb3Q9CTN4 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rhobtb3Q9CTN4 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rhobtb3Q9CTN4 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rhobtb3Q9CTN4 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rhobtb3Q9CTN4 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rhobtb3Q9CTN4 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rhobtb3Q9CTN4 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rhobtb3Q9CTN4 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rhobtb3Q9CTN4 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rhobtb3Q9CTN4 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rhobtb3Q9CTN4 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rhobtb3Q9CTN4 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rhobtb3Q9CTN4 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rhobtb3Q9CTN4 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rhobtb3Q9CTN4 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rhobtb3Q9CTN4 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rhobtb3Q9CTN4 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rhobtb3Q9CTN4 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rhobtb3Q9CTN4 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rhobtb3Q9CTN4 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rhobtb3Q9CTN4 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Rhobtb3Q9CTN4 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rhobtb3Q9CTN4 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rhobtb3Q9CTN4 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rhobtb3Q9CTN4 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rhobtb3Q9CTN4 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Rhobtb3Q9CTN4 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rhobtb3Q9CTN4 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rhobtb3Q9CTN4 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rhobtb3Q9CTN4 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rhobtb3Q9CTN4 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rhobtb3Q9CTN4 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rhobtb3Q9CTN4 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rhobtb3Q9CTN4 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rhobtb3Q9CTN4 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rhobtb3Q9CTN4 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rhobtb3Q9CTN4 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rhobtb3Q9CTN4 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Rhobtb3Q9CTN4 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rhobtb3Q9CTN4 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rhobtb3Q9CTN4 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rhobtb3Q9CTN4 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rhobtb3Q9CTN4 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rhobtb3Q9CTN4 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Rhobtb3Q9CTN4 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rhobtb3Q9CTN4 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Rhobtb3Q9CTN4 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rhobtb3Q9CTN4 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rhobtb3Q9CTN4 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Rhobtb3Q9CTN4 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Rhobtb3Q9CTN4 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Rhobtb3Q9CTN4 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rhobtb3Q9CTN4 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms