Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTG6

Atp13a2, Cation-transporting ATPase 13A2, mousemouse

Predictions only

Length 1,169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a2Q9CTG6 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp13a2Q9CTG6 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp13a2Q9CTG6 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp13a2Q9CTG6 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp13a2Q9CTG6 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp13a2Q9CTG6 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp13a2Q9CTG6 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp13a2Q9CTG6 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp13a2Q9CTG6 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp13a2Q9CTG6 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atp13a2Q9CTG6 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atp13a2Q9CTG6 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms