Protein–RNA interactions for Protein: Q9CS42

Prps2, Ribose-phosphate pyrophosphokinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prps2Q9CS42 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prps2Q9CS42 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prps2Q9CS42 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prps2Q9CS42 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prps2Q9CS42 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prps2Q9CS42 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prps2Q9CS42 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prps2Q9CS42 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prps2Q9CS42 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prps2Q9CS42 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prps2Q9CS42 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prps2Q9CS42 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prps2Q9CS42 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prps2Q9CS42 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prps2Q9CS42 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prps2Q9CS42 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prps2Q9CS42 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prps2Q9CS42 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prps2Q9CS42 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prps2Q9CS42 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prps2Q9CS42 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prps2Q9CS42 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prps2Q9CS42 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prps2Q9CS42 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prps2Q9CS42 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prps2Q9CS42 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Prps2Q9CS42 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prps2Q9CS42 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prps2Q9CS42 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prps2Q9CS42 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prps2Q9CS42 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prps2Q9CS42 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prps2Q9CS42 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prps2Q9CS42 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prps2Q9CS42 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prps2Q9CS42 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prps2Q9CS42 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prps2Q9CS42 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prps2Q9CS42 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prps2Q9CS42 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prps2Q9CS42 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prps2Q9CS42 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prps2Q9CS42 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prps2Q9CS42 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prps2Q9CS42 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prps2Q9CS42 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prps2Q9CS42 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prps2Q9CS42 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prps2Q9CS42 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prps2Q9CS42 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prps2Q9CS42 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prps2Q9CS42 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prps2Q9CS42 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prps2Q9CS42 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prps2Q9CS42 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prps2Q9CS42 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prps2Q9CS42 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prps2Q9CS42 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prps2Q9CS42 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prps2Q9CS42 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prps2Q9CS42 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prps2Q9CS42 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Prps2Q9CS42 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prps2Q9CS42 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Prps2Q9CS42 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prps2Q9CS42 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prps2Q9CS42 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prps2Q9CS42 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prps2Q9CS42 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prps2Q9CS42 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prps2Q9CS42 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prps2Q9CS42 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prps2Q9CS42 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prps2Q9CS42 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prps2Q9CS42 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prps2Q9CS42 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prps2Q9CS42 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prps2Q9CS42 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prps2Q9CS42 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prps2Q9CS42 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prps2Q9CS42 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prps2Q9CS42 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prps2Q9CS42 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Prps2Q9CS42 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prps2Q9CS42 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prps2Q9CS42 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prps2Q9CS42 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prps2Q9CS42 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prps2Q9CS42 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prps2Q9CS42 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prps2Q9CS42 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prps2Q9CS42 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prps2Q9CS42 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prps2Q9CS42 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prps2Q9CS42 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prps2Q9CS42 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prps2Q9CS42 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prps2Q9CS42 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prps2Q9CS42 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prps2Q9CS42 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms