Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRA8

Exosc5, Exosome complex component RRP46, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc5Q9CRA8 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Exosc5Q9CRA8 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Exosc5Q9CRA8 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Exosc5Q9CRA8 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Exosc5Q9CRA8 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Exosc5Q9CRA8 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Exosc5Q9CRA8 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Exosc5Q9CRA8 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Exosc5Q9CRA8 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Exosc5Q9CRA8 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Exosc5Q9CRA8 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Exosc5Q9CRA8 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Exosc5Q9CRA8 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Exosc5Q9CRA8 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms