Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRA4

Msmo1, Methylsterol monooxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msmo1Q9CRA4 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Msmo1Q9CRA4 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Msmo1Q9CRA4 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Msmo1Q9CRA4 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Msmo1Q9CRA4 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Msmo1Q9CRA4 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Msmo1Q9CRA4 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Msmo1Q9CRA4 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Msmo1Q9CRA4 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Msmo1Q9CRA4 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Msmo1Q9CRA4 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Msmo1Q9CRA4 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Msmo1Q9CRA4 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Msmo1Q9CRA4 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Msmo1Q9CRA4 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Msmo1Q9CRA4 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Msmo1Q9CRA4 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Msmo1Q9CRA4 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Msmo1Q9CRA4 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Msmo1Q9CRA4 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Msmo1Q9CRA4 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Msmo1Q9CRA4 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Msmo1Q9CRA4 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Msmo1Q9CRA4 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Msmo1Q9CRA4 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Msmo1Q9CRA4 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Msmo1Q9CRA4 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Msmo1Q9CRA4 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Msmo1Q9CRA4 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Msmo1Q9CRA4 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Msmo1Q9CRA4 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Msmo1Q9CRA4 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Msmo1Q9CRA4 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Msmo1Q9CRA4 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Msmo1Q9CRA4 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Msmo1Q9CRA4 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Msmo1Q9CRA4 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Msmo1Q9CRA4 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Msmo1Q9CRA4 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Msmo1Q9CRA4 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Msmo1Q9CRA4 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Msmo1Q9CRA4 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Msmo1Q9CRA4 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Msmo1Q9CRA4 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Msmo1Q9CRA4 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Msmo1Q9CRA4 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Msmo1Q9CRA4 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Msmo1Q9CRA4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Msmo1Q9CRA4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Msmo1Q9CRA4 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Msmo1Q9CRA4 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Msmo1Q9CRA4 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Msmo1Q9CRA4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Msmo1Q9CRA4 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Msmo1Q9CRA4 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Msmo1Q9CRA4 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Msmo1Q9CRA4 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Msmo1Q9CRA4 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Msmo1Q9CRA4 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Msmo1Q9CRA4 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Msmo1Q9CRA4 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Msmo1Q9CRA4 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Msmo1Q9CRA4 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Msmo1Q9CRA4 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Msmo1Q9CRA4 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Msmo1Q9CRA4 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Msmo1Q9CRA4 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Msmo1Q9CRA4 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Msmo1Q9CRA4 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Msmo1Q9CRA4 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Msmo1Q9CRA4 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Msmo1Q9CRA4 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Msmo1Q9CRA4 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Msmo1Q9CRA4 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Msmo1Q9CRA4 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Msmo1Q9CRA4 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Msmo1Q9CRA4 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Msmo1Q9CRA4 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Msmo1Q9CRA4 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Msmo1Q9CRA4 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Msmo1Q9CRA4 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Msmo1Q9CRA4 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Msmo1Q9CRA4 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Msmo1Q9CRA4 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Msmo1Q9CRA4 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Msmo1Q9CRA4 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Msmo1Q9CRA4 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Msmo1Q9CRA4 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Msmo1Q9CRA4 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Msmo1Q9CRA4 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Msmo1Q9CRA4 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Msmo1Q9CRA4 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Msmo1Q9CRA4 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Msmo1Q9CRA4 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Msmo1Q9CRA4 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Msmo1Q9CRA4 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Msmo1Q9CRA4 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Msmo1Q9CRA4 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Msmo1Q9CRA4 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Msmo1Q9CRA4 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms