Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR56

Nkiras2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkiras2Q9CR56 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkiras2Q9CR56 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkiras2Q9CR56 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkiras2Q9CR56 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkiras2Q9CR56 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkiras2Q9CR56 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkiras2Q9CR56 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkiras2Q9CR56 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkiras2Q9CR56 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkiras2Q9CR56 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkiras2Q9CR56 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkiras2Q9CR56 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkiras2Q9CR56 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkiras2Q9CR56 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkiras2Q9CR56 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkiras2Q9CR56 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkiras2Q9CR56 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkiras2Q9CR56 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkiras2Q9CR56 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkiras2Q9CR56 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkiras2Q9CR56 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkiras2Q9CR56 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkiras2Q9CR56 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkiras2Q9CR56 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkiras2Q9CR56 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkiras2Q9CR56 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkiras2Q9CR56 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkiras2Q9CR56 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkiras2Q9CR56 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkiras2Q9CR56 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nkiras2Q9CR56 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nkiras2Q9CR56 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nkiras2Q9CR56 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkiras2Q9CR56 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkiras2Q9CR56 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkiras2Q9CR56 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkiras2Q9CR56 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkiras2Q9CR56 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkiras2Q9CR56 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkiras2Q9CR56 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkiras2Q9CR56 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkiras2Q9CR56 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkiras2Q9CR56 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkiras2Q9CR56 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkiras2Q9CR56 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkiras2Q9CR56 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkiras2Q9CR56 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkiras2Q9CR56 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkiras2Q9CR56 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkiras2Q9CR56 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkiras2Q9CR56 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkiras2Q9CR56 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkiras2Q9CR56 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkiras2Q9CR56 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkiras2Q9CR56 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkiras2Q9CR56 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkiras2Q9CR56 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkiras2Q9CR56 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkiras2Q9CR56 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkiras2Q9CR56 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkiras2Q9CR56 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkiras2Q9CR56 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkiras2Q9CR56 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkiras2Q9CR56 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkiras2Q9CR56 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkiras2Q9CR56 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkiras2Q9CR56 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkiras2Q9CR56 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkiras2Q9CR56 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkiras2Q9CR56 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkiras2Q9CR56 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkiras2Q9CR56 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkiras2Q9CR56 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkiras2Q9CR56 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkiras2Q9CR56 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkiras2Q9CR56 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkiras2Q9CR56 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkiras2Q9CR56 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkiras2Q9CR56 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkiras2Q9CR56 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkiras2Q9CR56 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkiras2Q9CR56 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkiras2Q9CR56 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkiras2Q9CR56 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkiras2Q9CR56 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkiras2Q9CR56 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkiras2Q9CR56 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkiras2Q9CR56 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkiras2Q9CR56 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkiras2Q9CR56 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkiras2Q9CR56 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkiras2Q9CR56 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkiras2Q9CR56 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkiras2Q9CR56 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkiras2Q9CR56 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkiras2Q9CR56 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkiras2Q9CR56 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkiras2Q9CR56 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkiras2Q9CR56 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkiras2Q9CR56 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms