Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR55

UPF0547 protein C16orf87 homolog, mousemouse

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Length 154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CR55 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9CR55 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9CR55 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9CR55 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9CR55 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9CR55 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9CR55 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9CR55 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9CR55 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9CR55 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9CR55 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9CR55 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9CR55 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9CR55 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9CR55 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9CR55 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9CR55 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9CR55 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9CR55 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9CR55 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9CR55 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9CR55 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9CR55 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9CR55 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9CR55 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9CR55 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9CR55 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9CR55 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9CR55 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9CR55 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9CR55 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9CR55 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9CR55 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9CR55 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9CR55 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9CR55 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9CR55 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9CR55 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9CR55 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9CR55 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9CR55 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9CR55 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9CR55 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9CR55 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9CR55 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9CR55 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9CR55 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9CR55 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9CR55 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9CR55 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9CR55 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9CR55 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9CR55 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9CR55 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9CR55 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9CR55 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9CR55 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9CR55 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9CR55 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9CR55 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9CR55 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9CR55 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9CR55 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9CR55 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9CR55 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9CR55 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9CR55 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9CR55 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9CR55 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9CR55 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9CR55 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9CR55 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9CR55 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9CR55 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9CR55 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9CR55 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CR55 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CR55 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CR55 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CR55 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CR55 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CR55 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CR55 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CR55 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CR55 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CR55 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CR55 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CR55 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CR55 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CR55 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CR55 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CR55 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CR55 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CR55 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CR55 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CR55 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CR55 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CR55 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CR55 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CR55 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
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