Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR05

4931417E11Rik, RIKEN cDNA 4931417E11, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931417E11RikQ9CR05 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4931417E11RikQ9CR05 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms