Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg12Q9CQY1 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg12Q9CQY1 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg12Q9CQY1 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg12Q9CQY1 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg12Q9CQY1 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg12Q9CQY1 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg12Q9CQY1 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg12Q9CQY1 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg12Q9CQY1 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg12Q9CQY1 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg12Q9CQY1 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg12Q9CQY1 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg12Q9CQY1 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg12Q9CQY1 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg12Q9CQY1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg12Q9CQY1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg12Q9CQY1 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg12Q9CQY1 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg12Q9CQY1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg12Q9CQY1 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg12Q9CQY1 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg12Q9CQY1 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg12Q9CQY1 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg12Q9CQY1 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg12Q9CQY1 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg12Q9CQY1 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg12Q9CQY1 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg12Q9CQY1 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg12Q9CQY1 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg12Q9CQY1 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg12Q9CQY1 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg12Q9CQY1 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg12Q9CQY1 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Atg12Q9CQY1 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Atg12Q9CQY1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Atg12Q9CQY1 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Atg12Q9CQY1 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg12Q9CQY1 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg12Q9CQY1 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg12Q9CQY1 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg12Q9CQY1 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg12Q9CQY1 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg12Q9CQY1 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg12Q9CQY1 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg12Q9CQY1 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg12Q9CQY1 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg12Q9CQY1 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg12Q9CQY1 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg12Q9CQY1 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg12Q9CQY1 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg12Q9CQY1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg12Q9CQY1 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg12Q9CQY1 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg12Q9CQY1 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg12Q9CQY1 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg12Q9CQY1 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg12Q9CQY1 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg12Q9CQY1 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg12Q9CQY1 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg12Q9CQY1 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg12Q9CQY1 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg12Q9CQY1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg12Q9CQY1 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg12Q9CQY1 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg12Q9CQY1 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg12Q9CQY1 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg12Q9CQY1 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg12Q9CQY1 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg12Q9CQY1 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg12Q9CQY1 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg12Q9CQY1 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg12Q9CQY1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg12Q9CQY1 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg12Q9CQY1 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg12Q9CQY1 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg12Q9CQY1 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg12Q9CQY1 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg12Q9CQY1 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg12Q9CQY1 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg12Q9CQY1 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg12Q9CQY1 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg12Q9CQY1 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg12Q9CQY1 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg12Q9CQY1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg12Q9CQY1 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg12Q9CQY1 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg12Q9CQY1 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg12Q9CQY1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg12Q9CQY1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg12Q9CQY1 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg12Q9CQY1 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg12Q9CQY1 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg12Q9CQY1 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg12Q9CQY1 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg12Q9CQY1 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg12Q9CQY1 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg12Q9CQY1 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg12Q9CQY1 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg12Q9CQY1 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms