Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW9

Ifitm3, Interferon-induced transmembrane protein 3, mousemouse

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Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm3Q9CQW9 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifitm3Q9CQW9 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifitm3Q9CQW9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifitm3Q9CQW9 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifitm3Q9CQW9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifitm3Q9CQW9 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifitm3Q9CQW9 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifitm3Q9CQW9 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifitm3Q9CQW9 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifitm3Q9CQW9 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifitm3Q9CQW9 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifitm3Q9CQW9 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifitm3Q9CQW9 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifitm3Q9CQW9 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifitm3Q9CQW9 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifitm3Q9CQW9 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifitm3Q9CQW9 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifitm3Q9CQW9 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifitm3Q9CQW9 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifitm3Q9CQW9 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifitm3Q9CQW9 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifitm3Q9CQW9 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifitm3Q9CQW9 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifitm3Q9CQW9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifitm3Q9CQW9 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifitm3Q9CQW9 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifitm3Q9CQW9 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifitm3Q9CQW9 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifitm3Q9CQW9 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifitm3Q9CQW9 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifitm3Q9CQW9 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifitm3Q9CQW9 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifitm3Q9CQW9 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifitm3Q9CQW9 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifitm3Q9CQW9 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifitm3Q9CQW9 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifitm3Q9CQW9 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifitm3Q9CQW9 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifitm3Q9CQW9 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifitm3Q9CQW9 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifitm3Q9CQW9 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifitm3Q9CQW9 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifitm3Q9CQW9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifitm3Q9CQW9 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Ifitm3Q9CQW9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifitm3Q9CQW9 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifitm3Q9CQW9 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifitm3Q9CQW9 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifitm3Q9CQW9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifitm3Q9CQW9 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifitm3Q9CQW9 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifitm3Q9CQW9 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifitm3Q9CQW9 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Ifitm3Q9CQW9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Ifitm3Q9CQW9 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifitm3Q9CQW9 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifitm3Q9CQW9 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifitm3Q9CQW9 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifitm3Q9CQW9 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifitm3Q9CQW9 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifitm3Q9CQW9 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifitm3Q9CQW9 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifitm3Q9CQW9 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifitm3Q9CQW9 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifitm3Q9CQW9 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifitm3Q9CQW9 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifitm3Q9CQW9 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifitm3Q9CQW9 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifitm3Q9CQW9 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifitm3Q9CQW9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifitm3Q9CQW9 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifitm3Q9CQW9 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifitm3Q9CQW9 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifitm3Q9CQW9 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifitm3Q9CQW9 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifitm3Q9CQW9 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifitm3Q9CQW9 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifitm3Q9CQW9 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifitm3Q9CQW9 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifitm3Q9CQW9 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifitm3Q9CQW9 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifitm3Q9CQW9 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifitm3Q9CQW9 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifitm3Q9CQW9 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifitm3Q9CQW9 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifitm3Q9CQW9 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms