Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rdm1Q9CQK3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rdm1Q9CQK3 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rdm1Q9CQK3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rdm1Q9CQK3 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Rdm1Q9CQK3 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rdm1Q9CQK3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rdm1Q9CQK3 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rdm1Q9CQK3 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Rdm1Q9CQK3 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rdm1Q9CQK3 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rdm1Q9CQK3 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rdm1Q9CQK3 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rdm1Q9CQK3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rdm1Q9CQK3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rdm1Q9CQK3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rdm1Q9CQK3 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rdm1Q9CQK3 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rdm1Q9CQK3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rdm1Q9CQK3 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rdm1Q9CQK3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rdm1Q9CQK3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rdm1Q9CQK3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rdm1Q9CQK3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rdm1Q9CQK3 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rdm1Q9CQK3 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rdm1Q9CQK3 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rdm1Q9CQK3 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rdm1Q9CQK3 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rdm1Q9CQK3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rdm1Q9CQK3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rdm1Q9CQK3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rdm1Q9CQK3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rdm1Q9CQK3 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rdm1Q9CQK3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rdm1Q9CQK3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rdm1Q9CQK3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Rdm1Q9CQK3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Rdm1Q9CQK3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rdm1Q9CQK3 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rdm1Q9CQK3 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rdm1Q9CQK3 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rdm1Q9CQK3 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rdm1Q9CQK3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rdm1Q9CQK3 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rdm1Q9CQK3 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rdm1Q9CQK3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rdm1Q9CQK3 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Rdm1Q9CQK3 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rdm1Q9CQK3 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rdm1Q9CQK3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rdm1Q9CQK3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rdm1Q9CQK3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rdm1Q9CQK3 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rdm1Q9CQK3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rdm1Q9CQK3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rdm1Q9CQK3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rdm1Q9CQK3 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rdm1Q9CQK3 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rdm1Q9CQK3 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rdm1Q9CQK3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rdm1Q9CQK3 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rdm1Q9CQK3 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rdm1Q9CQK3 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rdm1Q9CQK3 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rdm1Q9CQK3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rdm1Q9CQK3 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rdm1Q9CQK3 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rdm1Q9CQK3 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rdm1Q9CQK3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rdm1Q9CQK3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rdm1Q9CQK3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rdm1Q9CQK3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rdm1Q9CQK3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rdm1Q9CQK3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rdm1Q9CQK3 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rdm1Q9CQK3 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rdm1Q9CQK3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rdm1Q9CQK3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rdm1Q9CQK3 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Rdm1Q9CQK3 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rdm1Q9CQK3 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rdm1Q9CQK3 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Rdm1Q9CQK3 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rdm1Q9CQK3 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Rdm1Q9CQK3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rdm1Q9CQK3 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rdm1Q9CQK3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rdm1Q9CQK3 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rdm1Q9CQK3 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rdm1Q9CQK3 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rdm1Q9CQK3 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rdm1Q9CQK3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rdm1Q9CQK3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rdm1Q9CQK3 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rdm1Q9CQK3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rdm1Q9CQK3 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rdm1Q9CQK3 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rdm1Q9CQK3 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rdm1Q9CQK3 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms