Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQI7

Snrpb2, U2 small nuclear ribonucleoprotein B'', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpb2Q9CQI7 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snrpb2Q9CQI7 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snrpb2Q9CQI7 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snrpb2Q9CQI7 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snrpb2Q9CQI7 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snrpb2Q9CQI7 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snrpb2Q9CQI7 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snrpb2Q9CQI7 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snrpb2Q9CQI7 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snrpb2Q9CQI7 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snrpb2Q9CQI7 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snrpb2Q9CQI7 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snrpb2Q9CQI7 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snrpb2Q9CQI7 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snrpb2Q9CQI7 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snrpb2Q9CQI7 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snrpb2Q9CQI7 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snrpb2Q9CQI7 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snrpb2Q9CQI7 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snrpb2Q9CQI7 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snrpb2Q9CQI7 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snrpb2Q9CQI7 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snrpb2Q9CQI7 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snrpb2Q9CQI7 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Snrpb2Q9CQI7 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snrpb2Q9CQI7 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snrpb2Q9CQI7 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snrpb2Q9CQI7 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snrpb2Q9CQI7 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snrpb2Q9CQI7 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snrpb2Q9CQI7 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snrpb2Q9CQI7 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snrpb2Q9CQI7 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snrpb2Q9CQI7 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snrpb2Q9CQI7 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snrpb2Q9CQI7 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snrpb2Q9CQI7 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snrpb2Q9CQI7 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Snrpb2Q9CQI7 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snrpb2Q9CQI7 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snrpb2Q9CQI7 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snrpb2Q9CQI7 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snrpb2Q9CQI7 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snrpb2Q9CQI7 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snrpb2Q9CQI7 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snrpb2Q9CQI7 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snrpb2Q9CQI7 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snrpb2Q9CQI7 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snrpb2Q9CQI7 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snrpb2Q9CQI7 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snrpb2Q9CQI7 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snrpb2Q9CQI7 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snrpb2Q9CQI7 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snrpb2Q9CQI7 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snrpb2Q9CQI7 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snrpb2Q9CQI7 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snrpb2Q9CQI7 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snrpb2Q9CQI7 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snrpb2Q9CQI7 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snrpb2Q9CQI7 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snrpb2Q9CQI7 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snrpb2Q9CQI7 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snrpb2Q9CQI7 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snrpb2Q9CQI7 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snrpb2Q9CQI7 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snrpb2Q9CQI7 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snrpb2Q9CQI7 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snrpb2Q9CQI7 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snrpb2Q9CQI7 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snrpb2Q9CQI7 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snrpb2Q9CQI7 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snrpb2Q9CQI7 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snrpb2Q9CQI7 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snrpb2Q9CQI7 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snrpb2Q9CQI7 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snrpb2Q9CQI7 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snrpb2Q9CQI7 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snrpb2Q9CQI7 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snrpb2Q9CQI7 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snrpb2Q9CQI7 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snrpb2Q9CQI7 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snrpb2Q9CQI7 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snrpb2Q9CQI7 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snrpb2Q9CQI7 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snrpb2Q9CQI7 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snrpb2Q9CQI7 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snrpb2Q9CQI7 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snrpb2Q9CQI7 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Snrpb2Q9CQI7 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Snrpb2Q9CQI7 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snrpb2Q9CQI7 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snrpb2Q9CQI7 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms