Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nudt21Q9CQF3 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nudt21Q9CQF3 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nudt21Q9CQF3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nudt21Q9CQF3 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nudt21Q9CQF3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nudt21Q9CQF3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nudt21Q9CQF3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nudt21Q9CQF3 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nudt21Q9CQF3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nudt21Q9CQF3 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nudt21Q9CQF3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nudt21Q9CQF3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nudt21Q9CQF3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nudt21Q9CQF3 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nudt21Q9CQF3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nudt21Q9CQF3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nudt21Q9CQF3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nudt21Q9CQF3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nudt21Q9CQF3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nudt21Q9CQF3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nudt21Q9CQF3 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Nudt21Q9CQF3 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nudt21Q9CQF3 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nudt21Q9CQF3 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Nudt21Q9CQF3 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nudt21Q9CQF3 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nudt21Q9CQF3 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Nudt21Q9CQF3 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Nudt21Q9CQF3 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nudt21Q9CQF3 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nudt21Q9CQF3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nudt21Q9CQF3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nudt21Q9CQF3 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nudt21Q9CQF3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nudt21Q9CQF3 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nudt21Q9CQF3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nudt21Q9CQF3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nudt21Q9CQF3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nudt21Q9CQF3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nudt21Q9CQF3 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nudt21Q9CQF3 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nudt21Q9CQF3 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nudt21Q9CQF3 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nudt21Q9CQF3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nudt21Q9CQF3 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nudt21Q9CQF3 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nudt21Q9CQF3 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nudt21Q9CQF3 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nudt21Q9CQF3 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nudt21Q9CQF3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nudt21Q9CQF3 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nudt21Q9CQF3 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nudt21Q9CQF3 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nudt21Q9CQF3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nudt21Q9CQF3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nudt21Q9CQF3 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nudt21Q9CQF3 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nudt21Q9CQF3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nudt21Q9CQF3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nudt21Q9CQF3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nudt21Q9CQF3 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nudt21Q9CQF3 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nudt21Q9CQF3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nudt21Q9CQF3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nudt21Q9CQF3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nudt21Q9CQF3 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nudt21Q9CQF3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nudt21Q9CQF3 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nudt21Q9CQF3 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nudt21Q9CQF3 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nudt21Q9CQF3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nudt21Q9CQF3 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nudt21Q9CQF3 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nudt21Q9CQF3 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nudt21Q9CQF3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nudt21Q9CQF3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nudt21Q9CQF3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nudt21Q9CQF3 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nudt21Q9CQF3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nudt21Q9CQF3 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nudt21Q9CQF3 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nudt21Q9CQF3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nudt21Q9CQF3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nudt21Q9CQF3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nudt21Q9CQF3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nudt21Q9CQF3 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nudt21Q9CQF3 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nudt21Q9CQF3 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nudt21Q9CQF3 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nudt21Q9CQF3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nudt21Q9CQF3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nudt21Q9CQF3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nudt21Q9CQF3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nudt21Q9CQF3 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nudt21Q9CQF3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nudt21Q9CQF3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nudt21Q9CQF3 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nudt21Q9CQF3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nudt21Q9CQF3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms