Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE1

Nipsnap3b, Protein NipSnap homolog 3B, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3bQ9CQE1 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms