Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Atp6v0e1Q9CQD8 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Atp6v0e1Q9CQD8 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Atp6v0e1Q9CQD8 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Atp6v0e1Q9CQD8 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Atp6v0e1Q9CQD8 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Atp6v0e1Q9CQD8 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atp6v0e1Q9CQD8 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Atp6v0e1Q9CQD8 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atp6v0e1Q9CQD8 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atp6v0e1Q9CQD8 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atp6v0e1Q9CQD8 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atp6v0e1Q9CQD8 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atp6v0e1Q9CQD8 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atp6v0e1Q9CQD8 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atp6v0e1Q9CQD8 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atp6v0e1Q9CQD8 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atp6v0e1Q9CQD8 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atp6v0e1Q9CQD8 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atp6v0e1Q9CQD8 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atp6v0e1Q9CQD8 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atp6v0e1Q9CQD8 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atp6v0e1Q9CQD8 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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