Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ36

Pole4, DNA polymerase epsilon subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole4Q9CQ36 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pole4Q9CQ36 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pole4Q9CQ36 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pole4Q9CQ36 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pole4Q9CQ36 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pole4Q9CQ36 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pole4Q9CQ36 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pole4Q9CQ36 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pole4Q9CQ36 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pole4Q9CQ36 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pole4Q9CQ36 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Pole4Q9CQ36 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Pole4Q9CQ36 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pole4Q9CQ36 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pole4Q9CQ36 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pole4Q9CQ36 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pole4Q9CQ36 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pole4Q9CQ36 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pole4Q9CQ36 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms