Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ11

2010109I03Rik, RIKEN cDNA 2010109I03, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2010109I03RikQ9CQ11 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
2010109I03RikQ9CQ11 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
2010109I03RikQ9CQ11 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
2010109I03RikQ9CQ11 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
2010109I03RikQ9CQ11 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
2010109I03RikQ9CQ11 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
2010109I03RikQ9CQ11 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
2010109I03RikQ9CQ11 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
2010109I03RikQ9CQ11 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
2010109I03RikQ9CQ11 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
2010109I03RikQ9CQ11 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
2010109I03RikQ9CQ11 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
2010109I03RikQ9CQ11 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
2010109I03RikQ9CQ11 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
2010109I03RikQ9CQ11 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
2010109I03RikQ9CQ11 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
2010109I03RikQ9CQ11 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
2010109I03RikQ9CQ11 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
2010109I03RikQ9CQ11 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
2010109I03RikQ9CQ11 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
2010109I03RikQ9CQ11 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
2010109I03RikQ9CQ11 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
2010109I03RikQ9CQ11 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
2010109I03RikQ9CQ11 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
2010109I03RikQ9CQ11 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
2010109I03RikQ9CQ11 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
2010109I03RikQ9CQ11 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
2010109I03RikQ9CQ11 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
2010109I03RikQ9CQ11 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
2010109I03RikQ9CQ11 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
2010109I03RikQ9CQ11 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
2010109I03RikQ9CQ11 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
2010109I03RikQ9CQ11 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
2010109I03RikQ9CQ11 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
2010109I03RikQ9CQ11 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
2010109I03RikQ9CQ11 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
2010109I03RikQ9CQ11 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
2010109I03RikQ9CQ11 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
2010109I03RikQ9CQ11 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
2010109I03RikQ9CQ11 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
2010109I03RikQ9CQ11 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
2010109I03RikQ9CQ11 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
2010109I03RikQ9CQ11 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
2010109I03RikQ9CQ11 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
2010109I03RikQ9CQ11 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
2010109I03RikQ9CQ11 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
2010109I03RikQ9CQ11 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
2010109I03RikQ9CQ11 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
2010109I03RikQ9CQ11 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
2010109I03RikQ9CQ11 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
2010109I03RikQ9CQ11 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
2010109I03RikQ9CQ11 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
2010109I03RikQ9CQ11 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
2010109I03RikQ9CQ11 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
2010109I03RikQ9CQ11 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
2010109I03RikQ9CQ11 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
2010109I03RikQ9CQ11 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
2010109I03RikQ9CQ11 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
2010109I03RikQ9CQ11 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
2010109I03RikQ9CQ11 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
2010109I03RikQ9CQ11 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
2010109I03RikQ9CQ11 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
2010109I03RikQ9CQ11 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
2010109I03RikQ9CQ11 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
2010109I03RikQ9CQ11 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
2010109I03RikQ9CQ11 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
2010109I03RikQ9CQ11 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
2010109I03RikQ9CQ11 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
2010109I03RikQ9CQ11 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
2010109I03RikQ9CQ11 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
2010109I03RikQ9CQ11 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
2010109I03RikQ9CQ11 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
2010109I03RikQ9CQ11 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
2010109I03RikQ9CQ11 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
2010109I03RikQ9CQ11 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
2010109I03RikQ9CQ11 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
2010109I03RikQ9CQ11 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
2010109I03RikQ9CQ11 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
2010109I03RikQ9CQ11 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
2010109I03RikQ9CQ11 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
2010109I03RikQ9CQ11 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
2010109I03RikQ9CQ11 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
2010109I03RikQ9CQ11 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
2010109I03RikQ9CQ11 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
2010109I03RikQ9CQ11 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
2010109I03RikQ9CQ11 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
2010109I03RikQ9CQ11 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
2010109I03RikQ9CQ11 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
2010109I03RikQ9CQ11 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
2010109I03RikQ9CQ11 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
2010109I03RikQ9CQ11 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
2010109I03RikQ9CQ11 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
2010109I03RikQ9CQ11 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
2010109I03RikQ9CQ11 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
2010109I03RikQ9CQ11 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
2010109I03RikQ9CQ11 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
2010109I03RikQ9CQ11 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
2010109I03RikQ9CQ11 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
2010109I03RikQ9CQ11 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
2010109I03RikQ9CQ11 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms