Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Chmp3Q9CQ10 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Chmp3Q9CQ10 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Chmp3Q9CQ10 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Chmp3Q9CQ10 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Chmp3Q9CQ10 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Chmp3Q9CQ10 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Chmp3Q9CQ10 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Chmp3Q9CQ10 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Chmp3Q9CQ10 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Chmp3Q9CQ10 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Chmp3Q9CQ10 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Chmp3Q9CQ10 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Chmp3Q9CQ10 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Chmp3Q9CQ10 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Chmp3Q9CQ10 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Chmp3Q9CQ10 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Chmp3Q9CQ10 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Chmp3Q9CQ10 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Chmp3Q9CQ10 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Chmp3Q9CQ10 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Chmp3Q9CQ10 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Chmp3Q9CQ10 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Chmp3Q9CQ10 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Chmp3Q9CQ10 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Chmp3Q9CQ10 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Chmp3Q9CQ10 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Chmp3Q9CQ10 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Chmp3Q9CQ10 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Chmp3Q9CQ10 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Chmp3Q9CQ10 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Chmp3Q9CQ10 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Chmp3Q9CQ10 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Chmp3Q9CQ10 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Chmp3Q9CQ10 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Chmp3Q9CQ10 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Chmp3Q9CQ10 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Chmp3Q9CQ10 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Chmp3Q9CQ10 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Chmp3Q9CQ10 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Chmp3Q9CQ10 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Chmp3Q9CQ10 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Chmp3Q9CQ10 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Chmp3Q9CQ10 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Chmp3Q9CQ10 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Chmp3Q9CQ10 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Chmp3Q9CQ10 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Chmp3Q9CQ10 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Chmp3Q9CQ10 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Chmp3Q9CQ10 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Chmp3Q9CQ10 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Chmp3Q9CQ10 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Chmp3Q9CQ10 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Chmp3Q9CQ10 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Chmp3Q9CQ10 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Chmp3Q9CQ10 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Chmp3Q9CQ10 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Chmp3Q9CQ10 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Chmp3Q9CQ10 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Chmp3Q9CQ10 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Chmp3Q9CQ10 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Chmp3Q9CQ10 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Chmp3Q9CQ10 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Chmp3Q9CQ10 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Chmp3Q9CQ10 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Chmp3Q9CQ10 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Chmp3Q9CQ10 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Chmp3Q9CQ10 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
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Chmp3Q9CQ10 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Chmp3Q9CQ10 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
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Chmp3Q9CQ10 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Chmp3Q9CQ10 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Chmp3Q9CQ10 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Chmp3Q9CQ10 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Chmp3Q9CQ10 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Chmp3Q9CQ10 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Chmp3Q9CQ10 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Chmp3Q9CQ10 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Chmp3Q9CQ10 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Chmp3Q9CQ10 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Chmp3Q9CQ10 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Chmp3Q9CQ10 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Chmp3Q9CQ10 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Chmp3Q9CQ10 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Chmp3Q9CQ10 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Chmp3Q9CQ10 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Chmp3Q9CQ10 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Chmp3Q9CQ10 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Chmp3Q9CQ10 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Chmp3Q9CQ10 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Chmp3Q9CQ10 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Chmp3Q9CQ10 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Chmp3Q9CQ10 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Chmp3Q9CQ10 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Chmp3Q9CQ10 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Chmp3Q9CQ10 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Chmp3Q9CQ10 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
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