Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPV1

Ska1, Spindle and kinetochore-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska1Q9CPV1 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ska1Q9CPV1 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ska1Q9CPV1 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ska1Q9CPV1 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ska1Q9CPV1 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ska1Q9CPV1 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ska1Q9CPV1 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ska1Q9CPV1 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ska1Q9CPV1 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ska1Q9CPV1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ska1Q9CPV1 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ska1Q9CPV1 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ska1Q9CPV1 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ska1Q9CPV1 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ska1Q9CPV1 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ska1Q9CPV1 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ska1Q9CPV1 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ska1Q9CPV1 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ska1Q9CPV1 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ska1Q9CPV1 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ska1Q9CPV1 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ska1Q9CPV1 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ska1Q9CPV1 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ska1Q9CPV1 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ska1Q9CPV1 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ska1Q9CPV1 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ska1Q9CPV1 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ska1Q9CPV1 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ska1Q9CPV1 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ska1Q9CPV1 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ska1Q9CPV1 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ska1Q9CPV1 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ska1Q9CPV1 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ska1Q9CPV1 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ska1Q9CPV1 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ska1Q9CPV1 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ska1Q9CPV1 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ska1Q9CPV1 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ska1Q9CPV1 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ska1Q9CPV1 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ska1Q9CPV1 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ska1Q9CPV1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ska1Q9CPV1 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ska1Q9CPV1 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ska1Q9CPV1 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ska1Q9CPV1 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ska1Q9CPV1 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ska1Q9CPV1 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ska1Q9CPV1 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ska1Q9CPV1 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ska1Q9CPV1 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ska1Q9CPV1 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ska1Q9CPV1 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ska1Q9CPV1 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ska1Q9CPV1 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ska1Q9CPV1 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ska1Q9CPV1 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ska1Q9CPV1 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ska1Q9CPV1 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ska1Q9CPV1 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ska1Q9CPV1 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ska1Q9CPV1 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ska1Q9CPV1 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ska1Q9CPV1 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ska1Q9CPV1 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ska1Q9CPV1 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ska1Q9CPV1 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ska1Q9CPV1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ska1Q9CPV1 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ska1Q9CPV1 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ska1Q9CPV1 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ska1Q9CPV1 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ska1Q9CPV1 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ska1Q9CPV1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ska1Q9CPV1 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ska1Q9CPV1 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ska1Q9CPV1 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ska1Q9CPV1 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ska1Q9CPV1 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ska1Q9CPV1 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ska1Q9CPV1 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ska1Q9CPV1 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ska1Q9CPV1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ska1Q9CPV1 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ska1Q9CPV1 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ska1Q9CPV1 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ska1Q9CPV1 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ska1Q9CPV1 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ska1Q9CPV1 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ska1Q9CPV1 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ska1Q9CPV1 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ska1Q9CPV1 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ska1Q9CPV1 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ska1Q9CPV1 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ska1Q9CPV1 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ska1Q9CPV1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms