Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR6

Krt88, Keratin 88, mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt88Q9CPR6 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt88Q9CPR6 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt88Q9CPR6 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt88Q9CPR6 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt88Q9CPR6 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt88Q9CPR6 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt88Q9CPR6 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt88Q9CPR6 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt88Q9CPR6 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt88Q9CPR6 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms