Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV8

Bcl11b, B-cell lymphoma/leukemia 11B, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl11bQ99PV8 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Bcl11bQ99PV8 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Bcl11bQ99PV8 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Bcl11bQ99PV8 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Bcl11bQ99PV8 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Bcl11bQ99PV8 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Bcl11bQ99PV8 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Bcl11bQ99PV8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Bcl11bQ99PV8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Bcl11bQ99PV8 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Bcl11bQ99PV8 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Bcl11bQ99PV8 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Bcl11bQ99PV8 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Bcl11bQ99PV8 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Bcl11bQ99PV8 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Bcl11bQ99PV8 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Bcl11bQ99PV8 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Bcl11bQ99PV8 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Bcl11bQ99PV8 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Bcl11bQ99PV8 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Bcl11bQ99PV8 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Bcl11bQ99PV8 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Bcl11bQ99PV8 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Bcl11bQ99PV8 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Bcl11bQ99PV8 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Bcl11bQ99PV8 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Bcl11bQ99PV8 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Bcl11bQ99PV8 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Bcl11bQ99PV8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Bcl11bQ99PV8 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Bcl11bQ99PV8 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Bcl11bQ99PV8 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Bcl11bQ99PV8 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Bcl11bQ99PV8 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Bcl11bQ99PV8 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Bcl11bQ99PV8 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Bcl11bQ99PV8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Bcl11bQ99PV8 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Bcl11bQ99PV8 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Bcl11bQ99PV8 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Bcl11bQ99PV8 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Bcl11bQ99PV8 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Bcl11bQ99PV8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Bcl11bQ99PV8 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Bcl11bQ99PV8 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Bcl11bQ99PV8 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Bcl11bQ99PV8 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Bcl11bQ99PV8 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Bcl11bQ99PV8 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Bcl11bQ99PV8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Bcl11bQ99PV8 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Bcl11bQ99PV8 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Bcl11bQ99PV8 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Bcl11bQ99PV8 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Bcl11bQ99PV8 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Bcl11bQ99PV8 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Bcl11bQ99PV8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Bcl11bQ99PV8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Bcl11bQ99PV8 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Bcl11bQ99PV8 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Bcl11bQ99PV8 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Bcl11bQ99PV8 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Bcl11bQ99PV8 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Bcl11bQ99PV8 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Bcl11bQ99PV8 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Bcl11bQ99PV8 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Bcl11bQ99PV8 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Bcl11bQ99PV8 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Bcl11bQ99PV8 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Bcl11bQ99PV8 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Bcl11bQ99PV8 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Bcl11bQ99PV8 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Bcl11bQ99PV8 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Bcl11bQ99PV8 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Bcl11bQ99PV8 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Bcl11bQ99PV8 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Bcl11bQ99PV8 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Bcl11bQ99PV8 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Bcl11bQ99PV8 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Bcl11bQ99PV8 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Bcl11bQ99PV8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Bcl11bQ99PV8 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Bcl11bQ99PV8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Bcl11bQ99PV8 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Bcl11bQ99PV8 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Bcl11bQ99PV8 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Bcl11bQ99PV8 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Bcl11bQ99PV8 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Bcl11bQ99PV8 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Bcl11bQ99PV8 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Bcl11bQ99PV8 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Bcl11bQ99PV8 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Bcl11bQ99PV8 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Bcl11bQ99PV8 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Bcl11bQ99PV8 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Bcl11bQ99PV8 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Bcl11bQ99PV8 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Bcl11bQ99PV8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Bcl11bQ99PV8 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Bcl11bQ99PV8 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms