Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ1

Trim12a, Tripartite motif-containing protein 12A, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12aQ99PQ1 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim12aQ99PQ1 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim12aQ99PQ1 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim12aQ99PQ1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim12aQ99PQ1 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim12aQ99PQ1 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim12aQ99PQ1 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim12aQ99PQ1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim12aQ99PQ1 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim12aQ99PQ1 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim12aQ99PQ1 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim12aQ99PQ1 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim12aQ99PQ1 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim12aQ99PQ1 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim12aQ99PQ1 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim12aQ99PQ1 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim12aQ99PQ1 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim12aQ99PQ1 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim12aQ99PQ1 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim12aQ99PQ1 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim12aQ99PQ1 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim12aQ99PQ1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim12aQ99PQ1 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim12aQ99PQ1 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim12aQ99PQ1 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim12aQ99PQ1 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim12aQ99PQ1 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim12aQ99PQ1 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim12aQ99PQ1 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim12aQ99PQ1 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim12aQ99PQ1 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim12aQ99PQ1 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim12aQ99PQ1 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim12aQ99PQ1 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim12aQ99PQ1 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim12aQ99PQ1 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim12aQ99PQ1 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim12aQ99PQ1 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim12aQ99PQ1 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim12aQ99PQ1 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim12aQ99PQ1 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim12aQ99PQ1 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim12aQ99PQ1 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim12aQ99PQ1 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim12aQ99PQ1 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim12aQ99PQ1 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim12aQ99PQ1 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim12aQ99PQ1 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim12aQ99PQ1 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim12aQ99PQ1 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim12aQ99PQ1 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim12aQ99PQ1 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim12aQ99PQ1 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim12aQ99PQ1 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim12aQ99PQ1 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim12aQ99PQ1 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim12aQ99PQ1 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim12aQ99PQ1 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim12aQ99PQ1 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim12aQ99PQ1 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim12aQ99PQ1 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim12aQ99PQ1 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim12aQ99PQ1 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim12aQ99PQ1 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim12aQ99PQ1 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim12aQ99PQ1 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim12aQ99PQ1 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim12aQ99PQ1 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim12aQ99PQ1 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim12aQ99PQ1 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim12aQ99PQ1 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim12aQ99PQ1 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim12aQ99PQ1 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim12aQ99PQ1 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim12aQ99PQ1 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim12aQ99PQ1 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim12aQ99PQ1 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim12aQ99PQ1 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim12aQ99PQ1 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim12aQ99PQ1 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim12aQ99PQ1 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim12aQ99PQ1 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim12aQ99PQ1 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim12aQ99PQ1 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim12aQ99PQ1 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim12aQ99PQ1 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim12aQ99PQ1 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim12aQ99PQ1 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim12aQ99PQ1 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim12aQ99PQ1 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim12aQ99PQ1 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim12aQ99PQ1 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim12aQ99PQ1 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim12aQ99PQ1 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim12aQ99PQ1 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim12aQ99PQ1 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim12aQ99PQ1 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim12aQ99PQ1 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim12aQ99PQ1 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim12aQ99PQ1 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
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