Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gtf2a1Q99PM3 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Gtf2a1Q99PM3 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Gtf2a1Q99PM3 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Gtf2a1Q99PM3 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gtf2a1Q99PM3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gtf2a1Q99PM3 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Gtf2a1Q99PM3 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gtf2a1Q99PM3 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gtf2a1Q99PM3 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gtf2a1Q99PM3 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gtf2a1Q99PM3 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gtf2a1Q99PM3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gtf2a1Q99PM3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Gtf2a1Q99PM3 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gtf2a1Q99PM3 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gtf2a1Q99PM3 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gtf2a1Q99PM3 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gtf2a1Q99PM3 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gtf2a1Q99PM3 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gtf2a1Q99PM3 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gtf2a1Q99PM3 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gtf2a1Q99PM3 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gtf2a1Q99PM3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gtf2a1Q99PM3 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gtf2a1Q99PM3 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gtf2a1Q99PM3 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gtf2a1Q99PM3 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gtf2a1Q99PM3 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gtf2a1Q99PM3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gtf2a1Q99PM3 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gtf2a1Q99PM3 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gtf2a1Q99PM3 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gtf2a1Q99PM3 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gtf2a1Q99PM3 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gtf2a1Q99PM3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gtf2a1Q99PM3 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gtf2a1Q99PM3 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gtf2a1Q99PM3 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gtf2a1Q99PM3 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gtf2a1Q99PM3 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gtf2a1Q99PM3 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gtf2a1Q99PM3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gtf2a1Q99PM3 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gtf2a1Q99PM3 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gtf2a1Q99PM3 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gtf2a1Q99PM3 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gtf2a1Q99PM3 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gtf2a1Q99PM3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gtf2a1Q99PM3 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gtf2a1Q99PM3 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gtf2a1Q99PM3 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gtf2a1Q99PM3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gtf2a1Q99PM3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gtf2a1Q99PM3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gtf2a1Q99PM3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gtf2a1Q99PM3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gtf2a1Q99PM3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gtf2a1Q99PM3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gtf2a1Q99PM3 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gtf2a1Q99PM3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gtf2a1Q99PM3 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gtf2a1Q99PM3 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gtf2a1Q99PM3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gtf2a1Q99PM3 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gtf2a1Q99PM3 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gtf2a1Q99PM3 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gtf2a1Q99PM3 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gtf2a1Q99PM3 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gtf2a1Q99PM3 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gtf2a1Q99PM3 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gtf2a1Q99PM3 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gtf2a1Q99PM3 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gtf2a1Q99PM3 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gtf2a1Q99PM3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gtf2a1Q99PM3 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Gtf2a1Q99PM3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Gtf2a1Q99PM3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gtf2a1Q99PM3 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gtf2a1Q99PM3 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gtf2a1Q99PM3 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gtf2a1Q99PM3 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gtf2a1Q99PM3 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gtf2a1Q99PM3 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gtf2a1Q99PM3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gtf2a1Q99PM3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gtf2a1Q99PM3 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gtf2a1Q99PM3 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gtf2a1Q99PM3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gtf2a1Q99PM3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gtf2a1Q99PM3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gtf2a1Q99PM3 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gtf2a1Q99PM3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gtf2a1Q99PM3 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gtf2a1Q99PM3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gtf2a1Q99PM3 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gtf2a1Q99PM3 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gtf2a1Q99PM3 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gtf2a1Q99PM3 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gtf2a1Q99PM3 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms