Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL7

Scd3, Acyl-CoA desaturase 3, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd3Q99PL7 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scd3Q99PL7 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms