Protein–RNA interactions for Protein: Q99NE5

Rims1, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims1Q99NE5 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rims1Q99NE5 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Rims1Q99NE5 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Rims1Q99NE5 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rims1Q99NE5 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rims1Q99NE5 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rims1Q99NE5 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rims1Q99NE5 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rims1Q99NE5 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rims1Q99NE5 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rims1Q99NE5 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rims1Q99NE5 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Rims1Q99NE5 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rims1Q99NE5 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rims1Q99NE5 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rims1Q99NE5 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rims1Q99NE5 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rims1Q99NE5 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rims1Q99NE5 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rims1Q99NE5 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rims1Q99NE5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rims1Q99NE5 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rims1Q99NE5 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rims1Q99NE5 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rims1Q99NE5 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rims1Q99NE5 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rims1Q99NE5 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rims1Q99NE5 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rims1Q99NE5 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rims1Q99NE5 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rims1Q99NE5 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rims1Q99NE5 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rims1Q99NE5 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rims1Q99NE5 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rims1Q99NE5 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rims1Q99NE5 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rims1Q99NE5 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rims1Q99NE5 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rims1Q99NE5 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rims1Q99NE5 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rims1Q99NE5 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rims1Q99NE5 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rims1Q99NE5 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rims1Q99NE5 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rims1Q99NE5 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rims1Q99NE5 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Rims1Q99NE5 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Rims1Q99NE5 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rims1Q99NE5 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rims1Q99NE5 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rims1Q99NE5 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rims1Q99NE5 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rims1Q99NE5 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rims1Q99NE5 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rims1Q99NE5 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rims1Q99NE5 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rims1Q99NE5 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rims1Q99NE5 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rims1Q99NE5 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Rims1Q99NE5 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rims1Q99NE5 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rims1Q99NE5 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Rims1Q99NE5 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Rims1Q99NE5 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rims1Q99NE5 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rims1Q99NE5 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rims1Q99NE5 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rims1Q99NE5 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Rims1Q99NE5 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rims1Q99NE5 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rims1Q99NE5 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rims1Q99NE5 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rims1Q99NE5 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rims1Q99NE5 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rims1Q99NE5 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rims1Q99NE5 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rims1Q99NE5 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rims1Q99NE5 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rims1Q99NE5 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rims1Q99NE5 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Rims1Q99NE5 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rims1Q99NE5 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Rims1Q99NE5 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rims1Q99NE5 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rims1Q99NE5 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rims1Q99NE5 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rims1Q99NE5 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rims1Q99NE5 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rims1Q99NE5 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rims1Q99NE5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rims1Q99NE5 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rims1Q99NE5 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rims1Q99NE5 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rims1Q99NE5 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rims1Q99NE5 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rims1Q99NE5 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rims1Q99NE5 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rims1Q99NE5 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rims1Q99NE5 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rims1Q99NE5 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms