Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA2

Atoh8, Protein atonal homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh8Q99NA2 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Atoh8Q99NA2 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atoh8Q99NA2 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atoh8Q99NA2 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Atoh8Q99NA2 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Atoh8Q99NA2 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atoh8Q99NA2 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atoh8Q99NA2 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atoh8Q99NA2 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atoh8Q99NA2 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atoh8Q99NA2 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atoh8Q99NA2 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atoh8Q99NA2 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atoh8Q99NA2 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atoh8Q99NA2 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atoh8Q99NA2 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atoh8Q99NA2 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atoh8Q99NA2 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atoh8Q99NA2 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atoh8Q99NA2 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atoh8Q99NA2 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Atoh8Q99NA2 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atoh8Q99NA2 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atoh8Q99NA2 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atoh8Q99NA2 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atoh8Q99NA2 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atoh8Q99NA2 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atoh8Q99NA2 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atoh8Q99NA2 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atoh8Q99NA2 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atoh8Q99NA2 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Atoh8Q99NA2 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atoh8Q99NA2 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atoh8Q99NA2 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atoh8Q99NA2 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atoh8Q99NA2 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atoh8Q99NA2 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Atoh8Q99NA2 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atoh8Q99NA2 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atoh8Q99NA2 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atoh8Q99NA2 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atoh8Q99NA2 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atoh8Q99NA2 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atoh8Q99NA2 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atoh8Q99NA2 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atoh8Q99NA2 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atoh8Q99NA2 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Atoh8Q99NA2 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atoh8Q99NA2 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atoh8Q99NA2 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atoh8Q99NA2 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atoh8Q99NA2 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atoh8Q99NA2 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atoh8Q99NA2 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atoh8Q99NA2 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atoh8Q99NA2 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atoh8Q99NA2 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atoh8Q99NA2 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atoh8Q99NA2 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atoh8Q99NA2 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atoh8Q99NA2 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atoh8Q99NA2 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms