Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rnf17Q99MV7 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rnf17Q99MV7 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rnf17Q99MV7 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rnf17Q99MV7 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rnf17Q99MV7 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rnf17Q99MV7 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rnf17Q99MV7 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rnf17Q99MV7 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rnf17Q99MV7 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rnf17Q99MV7 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rnf17Q99MV7 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rnf17Q99MV7 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rnf17Q99MV7 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rnf17Q99MV7 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rnf17Q99MV7 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rnf17Q99MV7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rnf17Q99MV7 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rnf17Q99MV7 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rnf17Q99MV7 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rnf17Q99MV7 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rnf17Q99MV7 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Rnf17Q99MV7 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rnf17Q99MV7 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Rnf17Q99MV7 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rnf17Q99MV7 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rnf17Q99MV7 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rnf17Q99MV7 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rnf17Q99MV7 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rnf17Q99MV7 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Rnf17Q99MV7 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rnf17Q99MV7 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Rnf17Q99MV7 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rnf17Q99MV7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rnf17Q99MV7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rnf17Q99MV7 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rnf17Q99MV7 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rnf17Q99MV7 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rnf17Q99MV7 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rnf17Q99MV7 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rnf17Q99MV7 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rnf17Q99MV7 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Rnf17Q99MV7 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rnf17Q99MV7 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Rnf17Q99MV7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rnf17Q99MV7 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rnf17Q99MV7 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rnf17Q99MV7 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Rnf17Q99MV7 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rnf17Q99MV7 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rnf17Q99MV7 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rnf17Q99MV7 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rnf17Q99MV7 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Rnf17Q99MV7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rnf17Q99MV7 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rnf17Q99MV7 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rnf17Q99MV7 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Rnf17Q99MV7 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rnf17Q99MV7 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rnf17Q99MV7 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rnf17Q99MV7 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rnf17Q99MV7 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Rnf17Q99MV7 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rnf17Q99MV7 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rnf17Q99MV7 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rnf17Q99MV7 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rnf17Q99MV7 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rnf17Q99MV7 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rnf17Q99MV7 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rnf17Q99MV7 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rnf17Q99MV7 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rnf17Q99MV7 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rnf17Q99MV7 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rnf17Q99MV7 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rnf17Q99MV7 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rnf17Q99MV7 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rnf17Q99MV7 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rnf17Q99MV7 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rnf17Q99MV7 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rnf17Q99MV7 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rnf17Q99MV7 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rnf17Q99MV7 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rnf17Q99MV7 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rnf17Q99MV7 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rnf17Q99MV7 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Rnf17Q99MV7 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rnf17Q99MV7 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rnf17Q99MV7 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rnf17Q99MV7 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rnf17Q99MV7 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rnf17Q99MV7 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Rnf17Q99MV7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rnf17Q99MV7 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rnf17Q99MV7 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Rnf17Q99MV7 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rnf17Q99MV7 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rnf17Q99MV7 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rnf17Q99MV7 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rnf17Q99MV7 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rnf17Q99MV7 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms