Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI9

Clp1, Polyribonucleotide 5'-hydroxyl-kinase Clp1, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clp1Q99LI9 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clp1Q99LI9 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clp1Q99LI9 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clp1Q99LI9 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clp1Q99LI9 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clp1Q99LI9 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clp1Q99LI9 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clp1Q99LI9 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Clp1Q99LI9 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clp1Q99LI9 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clp1Q99LI9 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clp1Q99LI9 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clp1Q99LI9 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clp1Q99LI9 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clp1Q99LI9 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clp1Q99LI9 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clp1Q99LI9 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clp1Q99LI9 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clp1Q99LI9 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clp1Q99LI9 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clp1Q99LI9 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clp1Q99LI9 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clp1Q99LI9 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clp1Q99LI9 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clp1Q99LI9 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clp1Q99LI9 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clp1Q99LI9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clp1Q99LI9 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clp1Q99LI9 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clp1Q99LI9 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clp1Q99LI9 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clp1Q99LI9 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clp1Q99LI9 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clp1Q99LI9 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clp1Q99LI9 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clp1Q99LI9 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clp1Q99LI9 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clp1Q99LI9 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clp1Q99LI9 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clp1Q99LI9 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clp1Q99LI9 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clp1Q99LI9 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clp1Q99LI9 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clp1Q99LI9 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clp1Q99LI9 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Clp1Q99LI9 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Clp1Q99LI9 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clp1Q99LI9 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clp1Q99LI9 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clp1Q99LI9 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clp1Q99LI9 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Clp1Q99LI9 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clp1Q99LI9 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clp1Q99LI9 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clp1Q99LI9 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clp1Q99LI9 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clp1Q99LI9 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clp1Q99LI9 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clp1Q99LI9 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clp1Q99LI9 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clp1Q99LI9 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clp1Q99LI9 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clp1Q99LI9 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clp1Q99LI9 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clp1Q99LI9 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clp1Q99LI9 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clp1Q99LI9 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clp1Q99LI9 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clp1Q99LI9 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clp1Q99LI9 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clp1Q99LI9 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clp1Q99LI9 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clp1Q99LI9 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clp1Q99LI9 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clp1Q99LI9 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clp1Q99LI9 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clp1Q99LI9 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clp1Q99LI9 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clp1Q99LI9 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clp1Q99LI9 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clp1Q99LI9 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Clp1Q99LI9 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clp1Q99LI9 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clp1Q99LI9 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clp1Q99LI9 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clp1Q99LI9 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clp1Q99LI9 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clp1Q99LI9 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clp1Q99LI9 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clp1Q99LI9 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clp1Q99LI9 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clp1Q99LI9 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clp1Q99LI9 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clp1Q99LI9 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clp1Q99LI9 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clp1Q99LI9 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clp1Q99LI9 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clp1Q99LI9 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clp1Q99LI9 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clp1Q99LI9 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms