Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI7

Cstf3, Cleavage stimulation factor subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cstf3Q99LI7 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cstf3Q99LI7 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cstf3Q99LI7 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cstf3Q99LI7 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cstf3Q99LI7 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cstf3Q99LI7 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cstf3Q99LI7 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cstf3Q99LI7 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cstf3Q99LI7 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cstf3Q99LI7 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cstf3Q99LI7 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cstf3Q99LI7 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cstf3Q99LI7 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cstf3Q99LI7 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cstf3Q99LI7 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cstf3Q99LI7 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cstf3Q99LI7 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cstf3Q99LI7 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cstf3Q99LI7 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cstf3Q99LI7 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cstf3Q99LI7 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cstf3Q99LI7 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cstf3Q99LI7 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cstf3Q99LI7 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cstf3Q99LI7 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cstf3Q99LI7 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cstf3Q99LI7 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cstf3Q99LI7 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cstf3Q99LI7 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cstf3Q99LI7 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cstf3Q99LI7 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cstf3Q99LI7 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cstf3Q99LI7 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cstf3Q99LI7 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cstf3Q99LI7 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cstf3Q99LI7 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cstf3Q99LI7 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cstf3Q99LI7 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cstf3Q99LI7 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cstf3Q99LI7 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cstf3Q99LI7 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cstf3Q99LI7 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cstf3Q99LI7 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cstf3Q99LI7 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cstf3Q99LI7 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cstf3Q99LI7 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cstf3Q99LI7 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cstf3Q99LI7 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cstf3Q99LI7 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cstf3Q99LI7 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cstf3Q99LI7 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cstf3Q99LI7 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cstf3Q99LI7 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cstf3Q99LI7 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cstf3Q99LI7 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cstf3Q99LI7 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cstf3Q99LI7 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cstf3Q99LI7 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cstf3Q99LI7 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cstf3Q99LI7 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cstf3Q99LI7 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cstf3Q99LI7 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cstf3Q99LI7 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cstf3Q99LI7 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cstf3Q99LI7 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cstf3Q99LI7 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cstf3Q99LI7 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cstf3Q99LI7 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cstf3Q99LI7 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cstf3Q99LI7 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cstf3Q99LI7 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cstf3Q99LI7 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cstf3Q99LI7 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cstf3Q99LI7 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cstf3Q99LI7 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cstf3Q99LI7 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cstf3Q99LI7 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cstf3Q99LI7 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cstf3Q99LI7 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cstf3Q99LI7 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cstf3Q99LI7 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cstf3Q99LI7 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cstf3Q99LI7 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cstf3Q99LI7 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cstf3Q99LI7 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cstf3Q99LI7 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cstf3Q99LI7 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cstf3Q99LI7 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cstf3Q99LI7 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cstf3Q99LI7 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cstf3Q99LI7 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cstf3Q99LI7 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cstf3Q99LI7 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cstf3Q99LI7 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cstf3Q99LI7 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cstf3Q99LI7 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cstf3Q99LI7 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cstf3Q99LI7 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms