Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp16Q99LG0 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp16Q99LG0 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp16Q99LG0 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp16Q99LG0 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp16Q99LG0 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp16Q99LG0 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp16Q99LG0 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp16Q99LG0 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp16Q99LG0 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp16Q99LG0 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp16Q99LG0 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp16Q99LG0 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp16Q99LG0 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp16Q99LG0 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp16Q99LG0 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp16Q99LG0 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp16Q99LG0 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp16Q99LG0 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp16Q99LG0 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp16Q99LG0 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp16Q99LG0 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp16Q99LG0 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp16Q99LG0 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp16Q99LG0 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp16Q99LG0 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp16Q99LG0 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp16Q99LG0 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp16Q99LG0 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp16Q99LG0 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp16Q99LG0 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp16Q99LG0 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp16Q99LG0 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp16Q99LG0 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp16Q99LG0 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp16Q99LG0 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp16Q99LG0 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp16Q99LG0 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp16Q99LG0 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp16Q99LG0 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp16Q99LG0 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp16Q99LG0 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp16Q99LG0 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp16Q99LG0 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp16Q99LG0 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp16Q99LG0 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp16Q99LG0 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp16Q99LG0 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp16Q99LG0 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp16Q99LG0 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp16Q99LG0 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp16Q99LG0 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp16Q99LG0 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp16Q99LG0 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
Usp16Q99LG0 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp16Q99LG0 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp16Q99LG0 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp16Q99LG0 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp16Q99LG0 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp16Q99LG0 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp16Q99LG0 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp16Q99LG0 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp16Q99LG0 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp16Q99LG0 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp16Q99LG0 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp16Q99LG0 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp16Q99LG0 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp16Q99LG0 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp16Q99LG0 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp16Q99LG0 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp16Q99LG0 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp16Q99LG0 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp16Q99LG0 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp16Q99LG0 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp16Q99LG0 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp16Q99LG0 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp16Q99LG0 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp16Q99LG0 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp16Q99LG0 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp16Q99LG0 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp16Q99LG0 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp16Q99LG0 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp16Q99LG0 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp16Q99LG0 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp16Q99LG0 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp16Q99LG0 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp16Q99LG0 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp16Q99LG0 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp16Q99LG0 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp16Q99LG0 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp16Q99LG0 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp16Q99LG0 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp16Q99LG0 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp16Q99LG0 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp16Q99LG0 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp16Q99LG0 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp16Q99LG0 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp16Q99LG0 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp16Q99LG0 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp16Q99LG0 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms