Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU0

Vmp1, Vacuole membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmp1Q99KU0 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vmp1Q99KU0 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vmp1Q99KU0 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vmp1Q99KU0 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmp1Q99KU0 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmp1Q99KU0 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmp1Q99KU0 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmp1Q99KU0 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmp1Q99KU0 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmp1Q99KU0 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmp1Q99KU0 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmp1Q99KU0 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmp1Q99KU0 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmp1Q99KU0 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmp1Q99KU0 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmp1Q99KU0 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmp1Q99KU0 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmp1Q99KU0 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmp1Q99KU0 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmp1Q99KU0 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmp1Q99KU0 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmp1Q99KU0 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmp1Q99KU0 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmp1Q99KU0 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmp1Q99KU0 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmp1Q99KU0 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmp1Q99KU0 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmp1Q99KU0 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmp1Q99KU0 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmp1Q99KU0 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmp1Q99KU0 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmp1Q99KU0 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmp1Q99KU0 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmp1Q99KU0 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmp1Q99KU0 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmp1Q99KU0 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmp1Q99KU0 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmp1Q99KU0 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmp1Q99KU0 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmp1Q99KU0 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmp1Q99KU0 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmp1Q99KU0 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmp1Q99KU0 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmp1Q99KU0 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmp1Q99KU0 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmp1Q99KU0 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmp1Q99KU0 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmp1Q99KU0 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmp1Q99KU0 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmp1Q99KU0 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmp1Q99KU0 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmp1Q99KU0 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmp1Q99KU0 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmp1Q99KU0 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmp1Q99KU0 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmp1Q99KU0 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms