Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR3

Lactb2, Endoribonuclease LACTB2, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lactb2Q99KR3 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lactb2Q99KR3 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lactb2Q99KR3 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Lactb2Q99KR3 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lactb2Q99KR3 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Lactb2Q99KR3 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Lactb2Q99KR3 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lactb2Q99KR3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lactb2Q99KR3 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Lactb2Q99KR3 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lactb2Q99KR3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lactb2Q99KR3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lactb2Q99KR3 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lactb2Q99KR3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lactb2Q99KR3 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lactb2Q99KR3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lactb2Q99KR3 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lactb2Q99KR3 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lactb2Q99KR3 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lactb2Q99KR3 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lactb2Q99KR3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lactb2Q99KR3 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lactb2Q99KR3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lactb2Q99KR3 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lactb2Q99KR3 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lactb2Q99KR3 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lactb2Q99KR3 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lactb2Q99KR3 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lactb2Q99KR3 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lactb2Q99KR3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lactb2Q99KR3 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lactb2Q99KR3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lactb2Q99KR3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lactb2Q99KR3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lactb2Q99KR3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lactb2Q99KR3 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lactb2Q99KR3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lactb2Q99KR3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lactb2Q99KR3 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lactb2Q99KR3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lactb2Q99KR3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lactb2Q99KR3 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lactb2Q99KR3 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms