Protein–RNA interactions for Protein: Q99KP6

Prpf19, Pre-mRNA-processing factor 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf19Q99KP6 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf19Q99KP6 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms