Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN9

Clint1, Clathrin interactor 1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clint1Q99KN9 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clint1Q99KN9 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms