Protein–RNA interactions for Protein: Q99KE3

Dok4, Docking protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dok4Q99KE3 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Dok4Q99KE3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Dok4Q99KE3 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Dok4Q99KE3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Dok4Q99KE3 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Dok4Q99KE3 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Dok4Q99KE3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Dok4Q99KE3 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Dok4Q99KE3 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Dok4Q99KE3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Dok4Q99KE3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Dok4Q99KE3 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Dok4Q99KE3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Dok4Q99KE3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Dok4Q99KE3 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Dok4Q99KE3 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Dok4Q99KE3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dok4Q99KE3 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dok4Q99KE3 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dok4Q99KE3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dok4Q99KE3 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dok4Q99KE3 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dok4Q99KE3 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dok4Q99KE3 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dok4Q99KE3 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dok4Q99KE3 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dok4Q99KE3 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dok4Q99KE3 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dok4Q99KE3 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dok4Q99KE3 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dok4Q99KE3 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dok4Q99KE3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dok4Q99KE3 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dok4Q99KE3 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dok4Q99KE3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dok4Q99KE3 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dok4Q99KE3 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dok4Q99KE3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dok4Q99KE3 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dok4Q99KE3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dok4Q99KE3 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dok4Q99KE3 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dok4Q99KE3 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Dok4Q99KE3 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Dok4Q99KE3 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dok4Q99KE3 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dok4Q99KE3 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dok4Q99KE3 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dok4Q99KE3 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dok4Q99KE3 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dok4Q99KE3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dok4Q99KE3 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dok4Q99KE3 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dok4Q99KE3 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dok4Q99KE3 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Dok4Q99KE3 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Dok4Q99KE3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Dok4Q99KE3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Dok4Q99KE3 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Dok4Q99KE3 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dok4Q99KE3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dok4Q99KE3 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dok4Q99KE3 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dok4Q99KE3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dok4Q99KE3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dok4Q99KE3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dok4Q99KE3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dok4Q99KE3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dok4Q99KE3 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dok4Q99KE3 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dok4Q99KE3 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dok4Q99KE3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dok4Q99KE3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dok4Q99KE3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dok4Q99KE3 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dok4Q99KE3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dok4Q99KE3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dok4Q99KE3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dok4Q99KE3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dok4Q99KE3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dok4Q99KE3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dok4Q99KE3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dok4Q99KE3 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dok4Q99KE3 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dok4Q99KE3 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dok4Q99KE3 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dok4Q99KE3 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dok4Q99KE3 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dok4Q99KE3 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dok4Q99KE3 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dok4Q99KE3 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dok4Q99KE3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dok4Q99KE3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dok4Q99KE3 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dok4Q99KE3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dok4Q99KE3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dok4Q99KE3 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dok4Q99KE3 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dok4Q99KE3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dok4Q99KE3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms