Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp11Q99K46 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp11Q99K46 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp11Q99K46 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp11Q99K46 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp11Q99K46 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp11Q99K46 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp11Q99K46 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp11Q99K46 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp11Q99K46 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp11Q99K46 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp11Q99K46 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp11Q99K46 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp11Q99K46 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp11Q99K46 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp11Q99K46 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp11Q99K46 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp11Q99K46 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp11Q99K46 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp11Q99K46 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp11Q99K46 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp11Q99K46 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp11Q99K46 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp11Q99K46 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp11Q99K46 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp11Q99K46 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp11Q99K46 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp11Q99K46 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp11Q99K46 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp11Q99K46 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp11Q99K46 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp11Q99K46 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp11Q99K46 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp11Q99K46 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp11Q99K46 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp11Q99K46 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp11Q99K46 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp11Q99K46 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp11Q99K46 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp11Q99K46 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp11Q99K46 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp11Q99K46 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp11Q99K46 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp11Q99K46 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp11Q99K46 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp11Q99K46 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp11Q99K46 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp11Q99K46 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp11Q99K46 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp11Q99K46 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp11Q99K46 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp11Q99K46 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp11Q99K46 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp11Q99K46 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp11Q99K46 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp11Q99K46 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp11Q99K46 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp11Q99K46 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp11Q99K46 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp11Q99K46 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp11Q99K46 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp11Q99K46 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp11Q99K46 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp11Q99K46 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp11Q99K46 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp11Q99K46 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp11Q99K46 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp11Q99K46 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp11Q99K46 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp11Q99K46 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp11Q99K46 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp11Q99K46 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp11Q99K46 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp11Q99K46 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp11Q99K46 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp11Q99K46 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp11Q99K46 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp11Q99K46 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp11Q99K46 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp11Q99K46 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp11Q99K46 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp11Q99K46 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Usp11Q99K46 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp11Q99K46 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp11Q99K46 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp11Q99K46 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp11Q99K46 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp11Q99K46 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp11Q99K46 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp11Q99K46 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp11Q99K46 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp11Q99K46 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp11Q99K46 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp11Q99K46 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp11Q99K46 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp11Q99K46 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp11Q99K46 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp11Q99K46 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp11Q99K46 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp11Q99K46 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms