Protein–RNA interactions for Protein: Q99K23

Ufsp2, Ufm1-specific protease 2, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufsp2Q99K23 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ufsp2Q99K23 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ufsp2Q99K23 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ufsp2Q99K23 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ufsp2Q99K23 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ufsp2Q99K23 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ufsp2Q99K23 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ufsp2Q99K23 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ufsp2Q99K23 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ufsp2Q99K23 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ufsp2Q99K23 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ufsp2Q99K23 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ufsp2Q99K23 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ufsp2Q99K23 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ufsp2Q99K23 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ufsp2Q99K23 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ufsp2Q99K23 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ufsp2Q99K23 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ufsp2Q99K23 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ufsp2Q99K23 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ufsp2Q99K23 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ufsp2Q99K23 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ufsp2Q99K23 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ufsp2Q99K23 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ufsp2Q99K23 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ufsp2Q99K23 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ufsp2Q99K23 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ufsp2Q99K23 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ufsp2Q99K23 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ufsp2Q99K23 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ufsp2Q99K23 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ufsp2Q99K23 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ufsp2Q99K23 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ufsp2Q99K23 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ufsp2Q99K23 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ufsp2Q99K23 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ufsp2Q99K23 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ufsp2Q99K23 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ufsp2Q99K23 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ufsp2Q99K23 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ufsp2Q99K23 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ufsp2Q99K23 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ufsp2Q99K23 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ufsp2Q99K23 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ufsp2Q99K23 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ufsp2Q99K23 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ufsp2Q99K23 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ufsp2Q99K23 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ufsp2Q99K23 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ufsp2Q99K23 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ufsp2Q99K23 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ufsp2Q99K23 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ufsp2Q99K23 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ufsp2Q99K23 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ufsp2Q99K23 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ufsp2Q99K23 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ufsp2Q99K23 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ufsp2Q99K23 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ufsp2Q99K23 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ufsp2Q99K23 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ufsp2Q99K23 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ufsp2Q99K23 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ufsp2Q99K23 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ufsp2Q99K23 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ufsp2Q99K23 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ufsp2Q99K23 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ufsp2Q99K23 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ufsp2Q99K23 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ufsp2Q99K23 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ufsp2Q99K23 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ufsp2Q99K23 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ufsp2Q99K23 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ufsp2Q99K23 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ufsp2Q99K23 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ufsp2Q99K23 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ufsp2Q99K23 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ufsp2Q99K23 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ufsp2Q99K23 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ufsp2Q99K23 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ufsp2Q99K23 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ufsp2Q99K23 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ufsp2Q99K23 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ufsp2Q99K23 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ufsp2Q99K23 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ufsp2Q99K23 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ufsp2Q99K23 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ufsp2Q99K23 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ufsp2Q99K23 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ufsp2Q99K23 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ufsp2Q99K23 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ufsp2Q99K23 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ufsp2Q99K23 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ufsp2Q99K23 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ufsp2Q99K23 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ufsp2Q99K23 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ufsp2Q99K23 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ufsp2Q99K23 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ufsp2Q99K23 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ufsp2Q99K23 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ufsp2Q99K23 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms