Protein–RNA interactions for Protein: Q99JX1

Taf11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf11Q99JX1 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Taf11Q99JX1 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Taf11Q99JX1 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Taf11Q99JX1 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Taf11Q99JX1 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Taf11Q99JX1 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Taf11Q99JX1 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Taf11Q99JX1 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Taf11Q99JX1 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Taf11Q99JX1 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Taf11Q99JX1 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Taf11Q99JX1 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Taf11Q99JX1 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Taf11Q99JX1 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf11Q99JX1 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf11Q99JX1 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf11Q99JX1 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf11Q99JX1 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf11Q99JX1 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf11Q99JX1 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf11Q99JX1 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf11Q99JX1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf11Q99JX1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf11Q99JX1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf11Q99JX1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf11Q99JX1 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf11Q99JX1 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf11Q99JX1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf11Q99JX1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf11Q99JX1 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf11Q99JX1 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf11Q99JX1 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf11Q99JX1 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf11Q99JX1 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf11Q99JX1 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf11Q99JX1 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf11Q99JX1 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf11Q99JX1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf11Q99JX1 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf11Q99JX1 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf11Q99JX1 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Taf11Q99JX1 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Taf11Q99JX1 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Taf11Q99JX1 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Taf11Q99JX1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Taf11Q99JX1 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Taf11Q99JX1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms