Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT6

Tlcd1, Calfacilitin, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlcd1Q99JT6 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tlcd1Q99JT6 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tlcd1Q99JT6 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tlcd1Q99JT6 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tlcd1Q99JT6 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tlcd1Q99JT6 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tlcd1Q99JT6 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tlcd1Q99JT6 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tlcd1Q99JT6 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tlcd1Q99JT6 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tlcd1Q99JT6 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tlcd1Q99JT6 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tlcd1Q99JT6 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Tlcd1Q99JT6 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tlcd1Q99JT6 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tlcd1Q99JT6 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tlcd1Q99JT6 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Tlcd1Q99JT6 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tlcd1Q99JT6 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tlcd1Q99JT6 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tlcd1Q99JT6 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tlcd1Q99JT6 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tlcd1Q99JT6 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tlcd1Q99JT6 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tlcd1Q99JT6 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tlcd1Q99JT6 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Tlcd1Q99JT6 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tlcd1Q99JT6 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tlcd1Q99JT6 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tlcd1Q99JT6 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tlcd1Q99JT6 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tlcd1Q99JT6 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tlcd1Q99JT6 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tlcd1Q99JT6 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tlcd1Q99JT6 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tlcd1Q99JT6 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tlcd1Q99JT6 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tlcd1Q99JT6 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Tlcd1Q99JT6 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tlcd1Q99JT6 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tlcd1Q99JT6 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tlcd1Q99JT6 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tlcd1Q99JT6 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tlcd1Q99JT6 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tlcd1Q99JT6 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Tlcd1Q99JT6 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tlcd1Q99JT6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tlcd1Q99JT6 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tlcd1Q99JT6 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tlcd1Q99JT6 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tlcd1Q99JT6 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tlcd1Q99JT6 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tlcd1Q99JT6 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tlcd1Q99JT6 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tlcd1Q99JT6 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tlcd1Q99JT6 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tlcd1Q99JT6 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tlcd1Q99JT6 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tlcd1Q99JT6 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tlcd1Q99JT6 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tlcd1Q99JT6 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tlcd1Q99JT6 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tlcd1Q99JT6 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tlcd1Q99JT6 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tlcd1Q99JT6 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tlcd1Q99JT6 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tlcd1Q99JT6 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tlcd1Q99JT6 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tlcd1Q99JT6 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tlcd1Q99JT6 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tlcd1Q99JT6 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tlcd1Q99JT6 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tlcd1Q99JT6 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tlcd1Q99JT6 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tlcd1Q99JT6 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tlcd1Q99JT6 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tlcd1Q99JT6 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tlcd1Q99JT6 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Tlcd1Q99JT6 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tlcd1Q99JT6 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tlcd1Q99JT6 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tlcd1Q99JT6 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Tlcd1Q99JT6 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tlcd1Q99JT6 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tlcd1Q99JT6 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tlcd1Q99JT6 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tlcd1Q99JT6 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tlcd1Q99JT6 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tlcd1Q99JT6 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tlcd1Q99JT6 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tlcd1Q99JT6 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tlcd1Q99JT6 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tlcd1Q99JT6 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tlcd1Q99JT6 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tlcd1Q99JT6 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tlcd1Q99JT6 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tlcd1Q99JT6 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tlcd1Q99JT6 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tlcd1Q99JT6 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tlcd1Q99JT6 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms