Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT5

Krcc1, Lysine-rich coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krcc1Q99JT5 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms