Protein–RNA interactions for Protein: Q99J31

Ophn1, Oligophrenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ophn1Q99J31 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ophn1Q99J31 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ophn1Q99J31 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ophn1Q99J31 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ophn1Q99J31 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ophn1Q99J31 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ophn1Q99J31 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ophn1Q99J31 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ophn1Q99J31 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ophn1Q99J31 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ophn1Q99J31 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ophn1Q99J31 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ophn1Q99J31 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ophn1Q99J31 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ophn1Q99J31 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ophn1Q99J31 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ophn1Q99J31 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ophn1Q99J31 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ophn1Q99J31 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ophn1Q99J31 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ophn1Q99J31 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ophn1Q99J31 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ophn1Q99J31 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ophn1Q99J31 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ophn1Q99J31 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ophn1Q99J31 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ophn1Q99J31 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ophn1Q99J31 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ophn1Q99J31 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ophn1Q99J31 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ophn1Q99J31 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ophn1Q99J31 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ophn1Q99J31 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ophn1Q99J31 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ophn1Q99J31 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ophn1Q99J31 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ophn1Q99J31 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ophn1Q99J31 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ophn1Q99J31 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ophn1Q99J31 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ophn1Q99J31 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ophn1Q99J31 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ophn1Q99J31 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ophn1Q99J31 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ophn1Q99J31 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ophn1Q99J31 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ophn1Q99J31 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ophn1Q99J31 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ophn1Q99J31 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ophn1Q99J31 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ophn1Q99J31 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ophn1Q99J31 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ophn1Q99J31 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ophn1Q99J31 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ophn1Q99J31 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ophn1Q99J31 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ophn1Q99J31 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ophn1Q99J31 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ophn1Q99J31 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ophn1Q99J31 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ophn1Q99J31 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ophn1Q99J31 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ophn1Q99J31 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ophn1Q99J31 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ophn1Q99J31 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ophn1Q99J31 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ophn1Q99J31 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ophn1Q99J31 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ophn1Q99J31 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ophn1Q99J31 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ophn1Q99J31 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ophn1Q99J31 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ophn1Q99J31 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ophn1Q99J31 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ophn1Q99J31 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ophn1Q99J31 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ophn1Q99J31 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ophn1Q99J31 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ophn1Q99J31 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ophn1Q99J31 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ophn1Q99J31 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ophn1Q99J31 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ophn1Q99J31 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ophn1Q99J31 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ophn1Q99J31 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ophn1Q99J31 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ophn1Q99J31 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ophn1Q99J31 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ophn1Q99J31 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ophn1Q99J31 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ophn1Q99J31 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ophn1Q99J31 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ophn1Q99J31 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ophn1Q99J31 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ophn1Q99J31 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ophn1Q99J31 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ophn1Q99J31 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ophn1Q99J31 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ophn1Q99J31 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ophn1Q99J31 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms